RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022220.12

Msh3-201, Transcript of DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msh3, Length 3,937 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3-201ENSMUST00000022220 Nox4Q9JHI8 578 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Phf1Q9Z1B8 559 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Gm20489A2AGH5 449 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Nkx6-2D3Z4R4 277 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Zmat3O54836 290 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 P01851 173 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 P01852 173 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 StarP51557 284 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Crmp1P97427 572 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Adra1aP97718 466 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Slc30a2Q2HJ10 371 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Tcfl5Q32NY8 489 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Mc2rQ64326 296 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Dtx4Q6PDK8 616 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Gal3st2Q6XQH0 394 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Tas2r107Q7M725 308 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr285Q7TS17 319 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Slc16a14Q8K1C7 512 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr763Q8VGC1 309 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr1389Q8VGX0 311 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Lcn8Q924P3 175 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Med8Q9D7W5 268 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 RhcgQ9QXP0 498 aa9.97□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Abca7Q91V24 2159 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Gm20911A0A087WSS0 222 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Dpy19l1A6X919 746 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Trabd2bB1ATG9 517 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Fbxw28E9Q8A4 466 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Zfp605E9QAH2 694 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr294F7CWV4 335 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Vmn2r58K7N6V2 862 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Galr3O88853 370 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 FhitO89106 150 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Phxr1P15973 60 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Tead1P30051 426 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Fgf14P70379 247 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Stx4P70452 298 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Anxa11P97384 503 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Npas1P97459 594 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Tbccd1Q640P7 552 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Tfap2eQ6VUP9 442 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Uhrf2Q7TMI3 803 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr1106Q7TR57 312 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr728Q7TRM6 311 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Nudt15Q8BG93 170 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Cml2Q8CHQ9 238 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 FRRS1Q8K385 592 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Egln3Q91UZ4 239 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Spryd4Q91WK1 207 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Lnx2Q91XL2 687 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 AldobQ91Y97 364 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Ackr4Q924I3 350 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Zmat5Q9CQR5 170 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Snapc3Q9D2C9 407 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Gstz1Q9WVL0 216 aa9.96□□□□□ -0.81
Msh3-201ENSMUST00000022220 Skint10A7TZG1 354 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr173E9QAT7 321 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Nid1P10493 1245 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Hmx3P42581 356 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 CdaP56389 146 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Sec61a1P61620 476 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Tead3P70210 439 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Dlx5P70396 289 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr1136Q0VBI4 310 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Defb28Q3V2L0 89 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Rps27Q6ZWU9 84 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Wdr92Q8BGF3 357 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr168Q8VF05 312 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr837Q8VFJ4 312 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr73Q920P2 313 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Abcg5Q99PE8 652 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Mrm2Q9CPY0 246 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Tomm34Q9CYG7 309 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Ptprz1B9EKR1 2312 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 EllO08856 602 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 AanatO88816 205 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Slc6a12P31651 614 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Cpne2P59108 548 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 4930480E11RikQ0VG34 394 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Gpr39Q5U431 456 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Cd55Q61475 390 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Npr2Q6VVW5 1047 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Kcmf1Q80UY2 381 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Zer1Q80ZJ6 779 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Gm11541Q8C4D8 108 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Rbm48Q8K2X2 371 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Gid4Q9CPY6 217 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Ssna1Q9JJ94 119 aa9.96□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Gm5788A0A1Y7VK80 144 aa9.95□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Vmn1r177E9PXM3 309 aa9.95□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Vmn1r27K7N688 303 aa9.95□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Tlx3O55144 291 aa9.95□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 H2-Q10P01898 325 aa9.95□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Nkx2-6P43688 289 aa9.95□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Evx2P49749 475 aa9.95□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 HbegfQ06186 208 aa9.95□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Atf7ip2Q3UL97 452 aa9.95□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Spin2cQ6NVE3 257 aa9.95□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Olfr128Q7TRJ1 308 aa9.95□□□□□ -0.82
Msh3-201ENSMUST00000022220 Prss34Q80UR4 318 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.6 ms