Protein–RNA interactions for Protein: K7N688

Vmn1r27, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r27K7N688 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,91■■■□□ 2,7
Vmn1r27K7N688 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Vmn1r27K7N688 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Vmn1r27K7N688 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Vmn1r27K7N688 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Vmn1r27K7N688 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Vmn1r27K7N688 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Vmn1r27K7N688 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Vmn1r27K7N688 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Vmn1r27K7N688 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Vmn1r27K7N688 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Vmn1r27K7N688 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Vmn1r27K7N688 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Vmn1r27K7N688 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Vmn1r27K7N688 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Vmn1r27K7N688 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Vmn1r27K7N688 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Vmn1r27K7N688 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Vmn1r27K7N688 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Vmn1r27K7N688 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Vmn1r27K7N688 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Vmn1r27K7N688 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Vmn1r27K7N688 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Vmn1r27K7N688 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Vmn1r27K7N688 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Vmn1r27K7N688 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Vmn1r27K7N688 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Vmn1r27K7N688 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Vmn1r27K7N688 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Vmn1r27K7N688 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
Vmn1r27K7N688 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Vmn1r27K7N688 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Vmn1r27K7N688 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Vmn1r27K7N688 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Vmn1r27K7N688 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Vmn1r27K7N688 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Vmn1r27K7N688 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Vmn1r27K7N688 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Vmn1r27K7N688 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Vmn1r27K7N688 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Vmn1r27K7N688 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,64■■□□□ 1,85
Vmn1r27K7N688 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Vmn1r27K7N688 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Vmn1r27K7N688 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Vmn1r27K7N688 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Vmn1r27K7N688 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Vmn1r27K7N688 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Vmn1r27K7N688 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Vmn1r27K7N688 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Vmn1r27K7N688 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Vmn1r27K7N688 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Vmn1r27K7N688 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Vmn1r27K7N688 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Vmn1r27K7N688 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Vmn1r27K7N688 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Vmn1r27K7N688 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Vmn1r27K7N688 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,76
Vmn1r27K7N688 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Vmn1r27K7N688 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Vmn1r27K7N688 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Vmn1r27K7N688 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Vmn1r27K7N688 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Vmn1r27K7N688 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Vmn1r27K7N688 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Vmn1r27K7N688 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Vmn1r27K7N688 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Vmn1r27K7N688 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Vmn1r27K7N688 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Vmn1r27K7N688 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Vmn1r27K7N688 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Vmn1r27K7N688 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Vmn1r27K7N688 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Vmn1r27K7N688 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Vmn1r27K7N688 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Vmn1r27K7N688 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Vmn1r27K7N688 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Vmn1r27K7N688 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Vmn1r27K7N688 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Vmn1r27K7N688 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Vmn1r27K7N688 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Vmn1r27K7N688 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Vmn1r27K7N688 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Vmn1r27K7N688 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Vmn1r27K7N688 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Vmn1r27K7N688 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Vmn1r27K7N688 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Vmn1r27K7N688 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Vmn1r27K7N688 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Vmn1r27K7N688 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Vmn1r27K7N688 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Vmn1r27K7N688 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Vmn1r27K7N688 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Vmn1r27K7N688 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Vmn1r27K7N688 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Vmn1r27K7N688 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Vmn1r27K7N688 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Vmn1r27K7N688 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Vmn1r27K7N688 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Vmn1r27K7N688 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Vmn1r27K7N688 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms