Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Tfap2eQ6VUP9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tfap2eQ6VUP9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tfap2eQ6VUP9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tfap2eQ6VUP9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tfap2eQ6VUP9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tfap2eQ6VUP9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tfap2eQ6VUP9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tfap2eQ6VUP9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tfap2eQ6VUP9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tfap2eQ6VUP9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tfap2eQ6VUP9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tfap2eQ6VUP9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tfap2eQ6VUP9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tfap2eQ6VUP9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tfap2eQ6VUP9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tfap2eQ6VUP9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tfap2eQ6VUP9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tfap2eQ6VUP9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tfap2eQ6VUP9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfap2eQ6VUP9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tfap2eQ6VUP9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tfap2eQ6VUP9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tfap2eQ6VUP9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tfap2eQ6VUP9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tfap2eQ6VUP9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfap2eQ6VUP9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfap2eQ6VUP9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tfap2eQ6VUP9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfap2eQ6VUP9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfap2eQ6VUP9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfap2eQ6VUP9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap2eQ6VUP9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfap2eQ6VUP9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfap2eQ6VUP9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfap2eQ6VUP9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap2eQ6VUP9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap2eQ6VUP9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap2eQ6VUP9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfap2eQ6VUP9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfap2eQ6VUP9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfap2eQ6VUP9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tfap2eQ6VUP9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfap2eQ6VUP9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfap2eQ6VUP9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfap2eQ6VUP9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfap2eQ6VUP9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfap2eQ6VUP9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfap2eQ6VUP9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfap2eQ6VUP9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfap2eQ6VUP9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfap2eQ6VUP9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfap2eQ6VUP9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tfap2eQ6VUP9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfap2eQ6VUP9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfap2eQ6VUP9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfap2eQ6VUP9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfap2eQ6VUP9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfap2eQ6VUP9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfap2eQ6VUP9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfap2eQ6VUP9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfap2eQ6VUP9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfap2eQ6VUP9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfap2eQ6VUP9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfap2eQ6VUP9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfap2eQ6VUP9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfap2eQ6VUP9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfap2eQ6VUP9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfap2eQ6VUP9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfap2eQ6VUP9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfap2eQ6VUP9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfap2eQ6VUP9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfap2eQ6VUP9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfap2eQ6VUP9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfap2eQ6VUP9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfap2eQ6VUP9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfap2eQ6VUP9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfap2eQ6VUP9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfap2eQ6VUP9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfap2eQ6VUP9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfap2eQ6VUP9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfap2eQ6VUP9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfap2eQ6VUP9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfap2eQ6VUP9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfap2eQ6VUP9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfap2eQ6VUP9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfap2eQ6VUP9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfap2eQ6VUP9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfap2eQ6VUP9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfap2eQ6VUP9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfap2eQ6VUP9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfap2eQ6VUP9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfap2eQ6VUP9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfap2eQ6VUP9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfap2eQ6VUP9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms