Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Vmn1r177E9PXM3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Vmn1r177E9PXM3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Vmn1r177E9PXM3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Vmn1r177E9PXM3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Vmn1r177E9PXM3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Vmn1r177E9PXM3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Vmn1r177E9PXM3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Vmn1r177E9PXM3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Vmn1r177E9PXM3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Vmn1r177E9PXM3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Vmn1r177E9PXM3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Vmn1r177E9PXM3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Vmn1r177E9PXM3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Vmn1r177E9PXM3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Vmn1r177E9PXM3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vmn1r177E9PXM3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vmn1r177E9PXM3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vmn1r177E9PXM3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Vmn1r177E9PXM3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vmn1r177E9PXM3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Vmn1r177E9PXM3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vmn1r177E9PXM3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vmn1r177E9PXM3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vmn1r177E9PXM3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vmn1r177E9PXM3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Vmn1r177E9PXM3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vmn1r177E9PXM3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vmn1r177E9PXM3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Vmn1r177E9PXM3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Vmn1r177E9PXM3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vmn1r177E9PXM3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vmn1r177E9PXM3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vmn1r177E9PXM3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vmn1r177E9PXM3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vmn1r177E9PXM3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vmn1r177E9PXM3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vmn1r177E9PXM3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vmn1r177E9PXM3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vmn1r177E9PXM3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vmn1r177E9PXM3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vmn1r177E9PXM3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vmn1r177E9PXM3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vmn1r177E9PXM3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Vmn1r177E9PXM3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vmn1r177E9PXM3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vmn1r177E9PXM3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vmn1r177E9PXM3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vmn1r177E9PXM3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vmn1r177E9PXM3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vmn1r177E9PXM3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vmn1r177E9PXM3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vmn1r177E9PXM3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vmn1r177E9PXM3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vmn1r177E9PXM3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Vmn1r177E9PXM3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Vmn1r177E9PXM3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vmn1r177E9PXM3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vmn1r177E9PXM3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn1r177E9PXM3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vmn1r177E9PXM3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vmn1r177E9PXM3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vmn1r177E9PXM3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Vmn1r177E9PXM3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vmn1r177E9PXM3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vmn1r177E9PXM3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vmn1r177E9PXM3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vmn1r177E9PXM3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn1r177E9PXM3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vmn1r177E9PXM3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vmn1r177E9PXM3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vmn1r177E9PXM3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Vmn1r177E9PXM3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vmn1r177E9PXM3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vmn1r177E9PXM3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vmn1r177E9PXM3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Vmn1r177E9PXM3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vmn1r177E9PXM3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vmn1r177E9PXM3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vmn1r177E9PXM3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vmn1r177E9PXM3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vmn1r177E9PXM3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vmn1r177E9PXM3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Vmn1r177E9PXM3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vmn1r177E9PXM3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vmn1r177E9PXM3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vmn1r177E9PXM3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vmn1r177E9PXM3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vmn1r177E9PXM3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Vmn1r177E9PXM3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vmn1r177E9PXM3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vmn1r177E9PXM3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vmn1r177E9PXM3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vmn1r177E9PXM3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vmn1r177E9PXM3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vmn1r177E9PXM3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vmn1r177E9PXM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vmn1r177E9PXM3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vmn1r177E9PXM3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vmn1r177E9PXM3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms