RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640039.1

SPIN3-233, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,067 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-233	ENST00000640039		H3BN98	237 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	SOX14	O95416	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	CST2	P09228	141 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	LAP3	P28838	519 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	CENPA	P49450	140 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	CCNI	Q14094	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	DAG1	Q14118	895 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ETFDH	Q16134	617 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	NUP37	Q8NFH4	326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	PERP	Q96FX8	193 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ZNF75A	Q96N20	296 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	NMNAT3	Q96T66	252 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	POLE4	Q9NR33	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	CA10	Q9NS85	328 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	BHLHE40	O14503	412 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	FCGR1A	P12314	374 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	BMP4	P12644	408 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ANXA8	P13928	327 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ZNF32	P17041	273 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	FAS	P25445	335 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	APLNR	P35414	380 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	PTH2R	P49190	550 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	KRT80	Q6KB66	452 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	BDH2	Q9BUT1	245 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	GSX2	Q9BZM3	304 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ATP5J2	P56134	94 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	HGFAC	Q04756	655 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ATP6AP1	Q15904	470 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	SYT9	Q86SS6	491 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	LNX2	Q8N448	690 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	TSSK2	Q96PF2	358 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	WAC	Q9BTA9	647 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	EMC7	Q9NPA0	242 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-233	ENST00000640039	OVOL3	O00110	214 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-233	ENST00000640039	IFNG	P01579	166 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-233	ENST00000640039	CD8A	P01732	235 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-233	ENST00000640039	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-233	ENST00000640039	ZNF35	P13682	527 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-233	ENST00000640039	PAX1	P15863	534 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-233	ENST00000640039	PRKACG	P22612	351 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-233	ENST00000640039	NR4A1	P22736	598 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-233	ENST00000640039	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-233	ENST00000640039	POU1F1	P28069	291 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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