RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560328.1

NEO1-208, Transcript of neogenin 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEO1, Length 5,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1-208ENST00000560328 OXGR1Q96P68 337 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TAS2R20P59543 309 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 PPP1CAP62136 330 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 DOK3Q7L591 496 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SYT9Q86SS6 491 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 HMGCLL1Q8TB92 370 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 OR51E1Q8TCB6 317 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 CXCL13O43927 109 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 ZNF254O75437 659 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 NKX2-2O95096 273 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 COMMD7Q86VX2 200 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 KIF18BQ86Y91 864 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 VN1R1Q9GZP7 353 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.5□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TCRBP04435 133 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TBXA2RP21731 343 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 LAP3P28838 519 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SSTR2P30874 369 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 FOXF1Q12946 379 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 RDH10Q8IZV5 341 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TAAR9Q96RI9 348 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 M0QYG6 137 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TGFBR1P36897 503 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 RFC3P40938 356 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 LTC4SQ16873 150 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SYS1Q8N2H4 156 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 OPALINQ96PE5 141 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 STK17BO94768 372 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TUBG1P23258 451 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 ABCD3P28288 659 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 CASP3P42574 277 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 CCR6P51684 374 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 OTPQ5XKR4 325 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 GPR119Q8TDV5 335 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TNFSF11O14788 317 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TSPAN15O95858 294 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 WNT11O96014 354 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 RAF1P04049 648 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 GUSBP08236 651 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 UBBP0CG47 229 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 ELK1P19419 428 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 GPNMBQ14956 572 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 NAXDQ8IW45 347 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 ZNF679Q8IYX0 411 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 OR4C3Q8NH37 302 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 MPPED1O15442 326 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SULT1B1O43704 296 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 NXPH2O95156 264 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 MPLP40238 635 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 CLDN15P56746 228 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 RAP2BP61225 183 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 EGR3Q06889 387 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 Q7L0L9 218 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 STK35Q8TDR2 534 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 ZNF681Q96N22 645 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.49□□□□□ -1.05
NEO1-208ENST00000560328 FAM60AQ9NP50 221 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms