RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 VRK2Q86Y07 508 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC18Q8N456 261 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 M1APQ8TC57 530 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LUZP4Q9P127 313 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TCFL5Q9UL49 500 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM218A2RU14 115 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 COLCA2A8K830 154 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 E9PQ18 207 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 M0QZK8 103 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DLL1O00548 723 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TSPAN2O60636 221 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FMO6PO60774 539 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFAND5O76080 213 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 AKR7A3O95154 331 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SIX6O95475 246 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 EPPINO95925 133 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1D-16P01601 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 COX6A1P12074 109 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 IFNGR1P15260 489 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CXCL2P19875 107 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CXCL3P19876 107 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TCN2P20062 427 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ABCD3P28288 659 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TACR3P29371 465 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 HMGA2P52926 109 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PNLIPRP2P54317 469 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SKP2Q13309 424 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8G1Q15617 311 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 APH1BQ8WW43 257 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DIO2Q92813 273 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GGHQ92820 318 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB3CQ96E17 227 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PRRC1Q96M27 445 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CDHR4A6H8M9 788 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CXorf65A6NEN9 183 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SOCS6O14544 535 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 EFSO43281 561 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DIRAS3O95661 229 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PTHP01270 115 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OPN1MWP04001 364 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF44P15621 663 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GABRB1P18505 474 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFRSF1BP20333 461 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TBXA2RP21731 343 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SDHBP21912 280 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1E2P47887 323 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LIMS1P48059 325 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NRG3P56975 720 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SPIBQ01892 262 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR176Q14439 515 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TPRA1Q86W33 373 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00471Q8N535 108 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.54□□□□□ -1.36
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