RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCBD1P61457 104 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GALK2Q01415 458 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSF2Q03933 536 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCNIQ14094 377 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD300LDQ6UXZ3 194 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF584Q8IVC4 421 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLB1L2Q8IW92 636 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC30A7Q8NEW0 376 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2T33Q8NG76 320 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PERPQ96FX8 193 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NMNAT3Q96T66 252 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GSX2Q9BZM3 304 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUAK2Q9H093 628 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CBLN4Q9NTU7 201 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPEF1Q9Y4P9 236 aa15.05■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C12orf71A8MTZ7 269 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H3BN98 237 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BHLHE40O14503 412 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FCGR1AP12314 374 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANXA8P13928 327 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF32P17041 273 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTH2RP49190 550 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DAG1Q14118 895 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP6AP1Q15904 470 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VHLLQ6RSH7 139 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TEX47Q8TBZ9 253 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WACQ9BTA9 647 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AP4S1Q9Y587 144 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALPK2Q86TB3 2170 aa15.04■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VSTM5A8MXK1 200 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OVOL3O00110 214 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BMP4P12644 408 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF35P13682 527 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PAX1P15863 534 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FASP25445 335 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APLNRP35414 380 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDKN1AP38936 164 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CENPAP49450 140 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HGFACQ04756 655 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT80Q6KB66 452 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYT9Q86SS6 491 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LNX2Q8N448 690 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATG16L2Q8NAA4 619 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR1J2Q8NGS2 313 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO17Q96EF6 278 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NRBF2Q96F24 287 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXN4Q96NZ1 517 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDH20Q9HBT6 801 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EMC7Q9NPA0 242 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF17Q9P2E2 1029 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITPR3Q14573 2671 aa15.03■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AKAP6Q13023 2319 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD8AP01732 235 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NR4A1P22736 598 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SERPINF1P36955 418 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP5J2P56134 94 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLO1Q04760 184 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC36A3Q495N2 470 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 Q5PR19 223 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHEQ5VZ18 495 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSSK2Q96PF2 358 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BDH2Q9BUT1 245 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2H1Q9GZK4 316 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NTN4Q9HB63 628 aa15.02■□□□□ -0
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms