RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 BET1O15155 118 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CIB2O75838 187 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 GABARAPO95166 117 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINA3P01011 423 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 AGTP01019 485 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 FABP3P05413 133 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPIND1P05546 499 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CALM1P0DP23 149 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CALM2P0DP24 149 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CALM3P0DP25 149 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMC3P17980 439 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CASP14P31944 242 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 DEKP35659 375 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CDKN2BP42772 138 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 RAP1AP62834 184 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 BST2Q10589 180 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ERCC8Q13216 396 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 SHHQ15465 462 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf185Q5T7R7 199 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ARMC12Q5T9G4 340 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 Q5W150 140 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC24Q6P3W2 148 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 C16orf87Q6PH81 154 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 TEX43Q6ZNM6 134 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 HDDC2Q7Z4H3 204 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 BIVMQ86UB2 503 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM228AQ86W67 206 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 RHEBL1Q8TAI7 183 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PIBF1Q8WXW3 757 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CREB3L1Q96BA8 519 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM3DQ96BQ1 224 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PIK3IP1Q96FE7 263 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PDXPQ96GD0 296 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 GSDMAQ96QA5 445 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CLSTN2Q9H4D0 955 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 EXO5Q9H790 373 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ISYNA1Q9NPH2 558 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ETNK2Q9NVF9 386 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF835Q9Y2P0 537 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 F6UB75 175 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R2P9O14990 202 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB3DO95716 219 aa2.15□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 POLR2MP0CAP2 368 aa2.15□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 SLC2A3P11169 496 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ANXA8P13928 327 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 NAMPTP43490 491 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CSNK1A1P48729 337 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ESRRGP62508 458 aa2.15□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 CLINT1Q14677 625 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 GINS1Q14691 196 aa2.15□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN26Q16670 478 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ANXA8L1Q5VT79 327 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD22Q5VYY1 191 aa2.15□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF709Q8N972 641 aa2.15□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 OR10R2Q8NGX6 335 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC2A14Q8TDB8 520 aa2.15□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf10Q9HB07 376 aa2.15□□□□□ -2.07
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RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL28Q9NXS3 571 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CNTNAP1P78357 1384 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A075B6Q4 140 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 M0QX08 132 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SPOPO43791 374 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CST1P01037 141 aa2.14□□□□□ -2.07
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