RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J GAC1P28006 793 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J BMH1P29311 267 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J HIR1P32479 840 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SWI3P32591 825 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J PEP7P32609 515 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM32P32644 1121 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J FRE1P32791 686 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J TKL2P33315 681 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J POL12P38121 705 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J KTR4P38131 464 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YBL036CP38197 257 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SAF1P38352 637 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RIM4P38741 713 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR054CP38780 354 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GIP4P39732 760 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NPP2P39997 493 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J FTR1P40088 404 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J TAF1P46677 1066 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J DAS1P47005 663 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SMC3P47037 1230 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J VTC4P47075 721 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS25P47142 202 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J LSC2P53312 427 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CWC24P53769 259 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CAF120P53836 1060 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MFB1Q04922 465 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YML053CQ04978 212 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J HRQ1Q05549 1077 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CUR1Q06469 252 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NSE1Q07913 336 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J AFT2Q08957 416 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GPM2Q12008 311 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR027CQ12079 277 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YRR1Q12172 810 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MED1Q12321 566 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NDJ1Q12366 352 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MOT1P32333 1867 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GAL10P04397 699 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J TPK1P06244 397 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J OM45P16547 393 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RNR1P21524 888 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J VMA4P22203 233 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J TSA1P34760 196 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR225WP38321 900 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SFB3P38810 929 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J FMO1P38866 432 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J AVT2P39981 480 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J BTT1P40314 149 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC1P40986 491 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SBE2P42223 864 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J PFD1P46988 109 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS70P47161 811 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR237CP50089 785 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J DRN1P53255 507 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data2.82□□□□□ -1.96not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J FAR11P53917 953 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J IMP4P53941 290 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL011CP53980 444 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data2.82□□□□□ -1.96not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J MTD1Q02046 320 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J STE20Q03497 939 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J TCO89Q08921 799 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J APC11Q12157 165 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J HOM2P13663 365 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MRM1P25270 412 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J PDC6P26263 563 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD16P31244 790 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J DAL1P32375 460 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC11P32458 415 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J GYP6P32806 458 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RPC25P35718 212 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J BCH2P36122 765 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC27P38042 758 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CBR1P38626 284 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NUP60P39705 539 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SAH1P39954 449 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YER130CP39959 443 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL161WP40449 235 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J RSM25P40496 264 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CHS6P40955 746 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J LSB6P42951 607 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J IES1P43579 692 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J ASG7P46993 209 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CPR7P47103 393 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J ATH1P48016 1211 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J PSP1P50896 841 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NMA2P53204 395 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J NIS1P53939 407 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J SEG1Q04279 960 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J TMN2Q04562 672 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J DON1Q05610 365 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J BSP1Q06604 576 aa2.81□□□□□ -1.96
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