RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)G2

tW(CCA)G2, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)G2, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GAC1P28006 793 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BMH1P29311 267 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HIR1P32479 840 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SWI3P32591 825 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PEP7P32609 515 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ECM32P32644 1121 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FRE1P32791 686 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TKL2P33315 681 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 POL12P38121 705 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 KTR4P38131 464 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YBL036CP38197 257 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SAF1P38352 637 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RIM4P38741 713 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YHR054CP38780 354 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GIP4P39732 760 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NPP2P39997 493 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FTR1P40088 404 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TAF1P46677 1066 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DAS1P47005 663 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SMC3P47037 1230 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VTC4P47075 721 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VPS25P47142 202 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LSC2P53312 427 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CWC24P53769 259 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CAF120P53836 1060 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MFB1Q04922 465 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YML053CQ04978 212 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HRQ1Q05549 1077 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CUR1Q06469 252 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NSE1Q07913 336 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AFT2Q08957 416 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GPM2Q12008 311 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YPR027CQ12079 277 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YRR1Q12172 810 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MED1Q12321 566 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NDJ1Q12366 352 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MOT1P32333 1867 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GAL10P04397 699 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TPK1P06244 397 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 OM45P16547 393 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RNR1P21524 888 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VMA4P22203 233 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TSA1P34760 196 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YBR225WP38321 900 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SFB3P38810 929 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FMO1P38866 432 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AVT2P39981 480 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BTT1P40314 149 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CDC1P40986 491 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SBE2P42223 864 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PFD1P46988 109 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VPS70P47161 811 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YGR237CP50089 785 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DRN1P53255 507 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data2.82□□□□□ -1.96not detected
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FAR11P53917 953 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 IMP4P53941 290 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YNL011CP53980 444 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data2.82□□□□□ -1.96not detected
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MTD1Q02046 320 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 STE20Q03497 939 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TCO89Q08921 799 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 APC11Q12157 165 aa2.82□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HOM2P13663 365 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRM1P25270 412 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PDC6P26263 563 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RAD16P31244 790 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DAL1P32375 460 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CDC11P32458 415 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GYP6P32806 458 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPC25P35718 212 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BCH2P36122 765 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CDC27P38042 758 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CBR1P38626 284 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NUP60P39705 539 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SAH1P39954 449 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YER130CP39959 443 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YIL161WP40449 235 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RSM25P40496 264 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CHS6P40955 746 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LSB6P42951 607 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 IES1P43579 692 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ASG7P46993 209 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CPR7P47103 393 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ATH1P48016 1211 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PSP1P50896 841 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NMA2P53204 395 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NIS1P53939 407 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SEG1Q04279 960 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TMN2Q04562 672 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DON1Q05610 365 aa2.81□□□□□ -1.96
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BSP1Q06604 576 aa2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 93.8 ms