RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A ATG13Q06628 738 aa0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A CDC53Q12018 815 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data0.94□□□□□ -2.26not detected
YPL060C-AYPL060C-A TRP4P07285 380 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YBR259WP38338 688 aa0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A PMT6P42934 759 aa0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A TEL2P53038 688 aa0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SNA4Q07549 140 aa0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A ILV2P07342 687 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A PIC2P40035 300 aa0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A TAH11P47112 604 aa0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A EXG2P52911 562 aa0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A NMA2P53204 395 aa0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A LCD1Q04377 747 aa0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A CDA1Q06702 301 aa0.93□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A TPK2P06245 380 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SLA2P33338 968 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A APN2P38207 520 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A PPE1P38796 400 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A PNT1P38969 423 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A TAX4P47030 604 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A ENP2P48234 707 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A GYP7P48365 746 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SNU71P53207 620 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A HXK1P04806 485 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A PRO3P32263 286 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A MSS51P32335 436 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A GMH1P36125 273 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A RRP3P38712 501 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A LTP1P40347 161 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A AIM41Q12032 185 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A IRC20Q06554 1556 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YLR415CO13578 112 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A ADY2P25613 283 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A MNR2P35724 969 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A GYP8P43570 497 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A ADY4Q05955 493 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A ARO10Q06408 635 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YKL033W-AQ86ZR7 236 aa0.92□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A DNA2P38859 1522 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A BAP2P38084 609 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A CCT3P39077 534 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SDP1P40479 209 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YGL260WP53056 76 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YML020WQ03722 664 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A TRL1P09880 827 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A BET2P20133 325 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SEC21P32074 935 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A GIC1P38785 314 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YEL020CP39994 560 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A SNO3P43544 222 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YJL163CP46996 555 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A TAD1P53065 400 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A YMR210WQ03649 449 aa0.91□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A MET4P32389 672 aa0.9□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A MUP3P38734 546 aa0.9□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A TOK1P40310 691 aa0.9□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A MON2P48563 1636 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.26
YPL060C-AYPL060C-A FUB1P25659 250 aa0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A BDH2P39713 417 aa0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YNL234WP53857 426 aa0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ESC2Q06340 456 aa0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A OPI10Q08202 246 aa0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YLL058WQ12198 575 aa0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ECM3Q99252 613 aa0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A NPP1P25353 742 aa0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A LSC1P53598 329 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A DAK1P54838 584 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A MET7Q08645 548 aa0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A UPC2Q12151 913 aa0.9□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A LAT1P12695 482 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A RAD4P14736 754 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A SIP1P32578 815 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YKL091CP33324 310 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A KSP1P38691 1029 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A SPC97P38863 823 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YIL077CP40508 320 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A MPH1P40562 993 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A PFA3P42836 336 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A CDC34P14682 295 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A SRM1P21827 482 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A TRS65P32893 560 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A RLP7P40693 322 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ALG2P43636 503 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ILS1P09436 1072 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A CHA4P43634 648 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YGR151CP53287 111 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A BOP3P53958 396 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A TGS1Q12052 315 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ULA1Q12059 462 aa0.89□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A CTT1P06115 562 aa0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A RAD18P10862 487 aa0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A PYC1P11154 1178 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A PRP22P24384 1145 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A HSL7P38274 827 aa0.88□□□□□ -2.27
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