RNA–Protein interactions for RNA: YLR297W

YLR297W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YLR297W, Length 390 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR297W	YLR297W	ALG7	P07286	448 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	CTF13	P35203	478 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	BET3	P36149	193 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	RPP1	P38786	293 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	NIT3	P49954	291 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	RNT1	Q02555	471 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	TAF8	Q03750	510 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	OAR1	P35731	278 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	SAK1	P38990	1142 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	RIP-Chip
YLR297W	YLR297W	RTA1	P53047	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	SSY5	P47002	699 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	TRM11	Q12463	433 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	LTE1	P07866	1435 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	CAN1	P04817	590 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	MET3	P08536	511 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	PER1	P25625	357 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	PPS1	P38148	807 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	PZF1	P39933	429 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	ELO3	P40319	345 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	MUP1	P50276	574 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	PKH1	Q03407	766 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	MCH5	Q08777	521 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	FRE5	Q08908	694 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	ALG2	P43636	503 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	DLT1	Q04216	342 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	TMN2	Q04562	672 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	ASM4	Q05166	528 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	EMC3	P36039	253 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	SHR5	P41912	237 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	ASI2	P53895	289 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	CRR1	Q05790	422 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	RSC3	Q06639	885 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	BDF2	Q07442	638 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	MET7	Q08645	548 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	ACF2	Q12168	779 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YLR297W	YLR297W	PFA3	P42836	336 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	DAM1	P53267	343 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	GND2	P53319	492 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	GIS1	Q03833	894 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	OMS1	Q06668	471 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	BNI1	P41832	1953 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	ERR1	P0CX10	437 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	ERR2	P0CX11	437 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	GAL11	P19659	1081 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	YJL049W	P47048	450 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	NRG1	Q03125	231 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	NSE3	Q05541	303 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	IML1	P47170	1584 aa		4	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	YLR415C	O13578	112 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	SPC42	P36094	363 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	TIM44	Q01852	431 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	IRC13	Q08630	104 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	MHP1	P43638	1398 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	DIF1	O13577	133 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	NGG1	P32494	702 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	SPC29	P33419	253 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	MTH1	P35198	433 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	YBR053C	P38235	358 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	PCL5	P38794	229 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	TY4A-J	P47023	414 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	ALY2	P47029	1046 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	ADY4	Q05955	493 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	REH1	Q06709	432 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	TGL5	Q12043	749 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	SCT1	P32784	759 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	STU2	P46675	888 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	YJL163C	P46996	555 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	NNF1	P47149	201 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YLR297W	YLR297W	THI21	Q08975	551 aa		3.97	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.6 ms