RNA–Protein interactions for RNA: YLR143W

DPH6, Transcript of Diphthamide synthetase, yeast

Gene DPH6, Length 2,058 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DPH6	YLR143W	VPS25	P47142	202 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	HST1	P53685	503 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	TLG2	Q08144	397 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SGO1	Q08490	590 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	KEX2	P13134	814 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	AMS1	P22855	1083 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
DPH6	YLR143W	YEL1	P34225	687 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	YBR284W	P38150	797 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	UBP5	P39944	805 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	BIM1	P40013	344 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SMC3	P47037	1230 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	NSE5	Q03718	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	IRC10	Q08118	586 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	APM4	Q99186	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	PCT1	P13259	424 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	CHS2	P14180	963 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	PEX1	P24004	1043 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	MET4	P32389	672 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	DSF2	P38213	736 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	LCB2	P40970	561 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	COS5	P47187	383 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	STB4	P50104	949 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	TIM8	P57744	87 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	MLH2	Q07980	695 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	GIS3	Q12418	502 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	OM45	P16547	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SLA2	P33338	968 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	TBS1	P38114	1094 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	CTM1	P38818	585 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	YPT11	P48559	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	TRK2	P28584	889 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SWI3	P32591	825 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	PEP7	P32609	515 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	BCD1	P38772	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	TOS3	P43637	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	COG4	Q06096	861 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	GYP1	Q08484	637 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	TPK1	P06244	397 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	PDE1	P22434	369 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	PEX34	P25584	144 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	FIG4	P42837	879 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	ALT1	P52893	592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SLG1	P54867	378 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	CDD1	Q06549	142 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	KEX1	P09620	729 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	GAC1	P28006	793 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	PEX2	P32800	271 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	TKL2	P33315	681 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	COY1	P34237	679 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	HXT5	P38695	592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	AIM44	Q99299	758 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	HIS5	P07172	385 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	YJR054W	P47114	497 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	TBF1	Q02457	562 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	NSE1	Q07913	336 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	GPM2	Q12008	311 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	HRT3	Q12347	344 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	GAL10	P04397	699 aa		4.71	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SPO11	P23179	398 aa		4.71	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	YBL036C	P38197	257 aa		4.71	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SFB3	P38810	929 aa		4.71	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	RAD55	P38953	406 aa		4.71	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	APC5	Q08683	685 aa		4.71	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	ISU2	Q12056	156 aa		4.71	□□□□□ -1.65
DPH6	YLR143W	CHS1	P08004	1131 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DPH6	YLR143W	SGF29	P25554	259 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DPH6	YLR143W	YKL097C	P34245	136 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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