RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	PIP2	P52960	996 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	MAL11	P53048	616 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	SNF12	P53628	566 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	YDR338C	Q05497	695 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	HBN1	Q96VH4	193 aa		0.97	□□□□□ -2.25
CSE1	YGL238W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	REC104	P33323	182 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YMC2	P38087	329 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PBY1	P38254	753 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YHR112C	P38716	378 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PZF1	P39933	429 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ARG2	P40360	574 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	DNA2	P38859	1522 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ERG11	P10614	530 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	SLD2	P34252	453 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	REV7	P38927	245 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	MTL1	P53214	551 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YML020W	Q03722	664 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	TAF8	Q03750	510 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	FMP25	Q08023	583 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		0.96	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PHO5	P00635	467 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PPH3	P32345	308 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	MRP8	P35719	219 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	EMC3	P36039	253 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	BET3	P36149	193 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.95	□□□□□ -2.26	not detected
CSE1	YGL238W	ARG5,6	Q01217	863 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ATP25	Q03153	612 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YDR306C	Q06640	478 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	FRE7	Q12333	620 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	INO80	P53115	1489 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	APN1	P22936	367 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	SPC29	P33419	253 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PHO11	P35842	467 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YRO2	P38079	344 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PHO12	P38693	467 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	NUP60	P39705	539 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	TAD1	P53065	400 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ATG4	P53867	494 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ARP4	P80428	489 aa		0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	RAD18	P10862	487 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	NUP1	P20676	1076 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YMC1	P32331	307 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YBR184W	P38299	523 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	MUP3	P38734	546 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	SAK1	P38990	1142 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	SSY5	P47002	699 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ZIP2	P53061	704 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ARG7	Q04728	441 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YBR259W	P38338	688 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	EAF1	Q06337	982 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	THI22	Q06490	572 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YOR022C	Q12204	715 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ASF1	P32447	279 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	BST1	P43571	1029 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.94	□□□□□ -2.26	not detected
CSE1	YGL238W	ORC4	P54791	529 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YPR071W	Q12346	211 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	DAL7	P21826	554 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	FUB1	P25659	250 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	SFB3	P38810	929 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	IRC8	P47046	822 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	STP1	Q00947	519 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	MCM21	Q06675	368 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	DNF1	P32660	1571 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	PRI2	P20457	528 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	MCD4	P36051	919 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	YBR284W	P38150	797 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSE1	YGL238W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.5 ms