RNA–Protein interactions for RNA: YBR143C

SUP45, Transcript of Polypeptide release factor (eRF1) in translation termination, yeast

Gene SUP45, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUP45	YBR143C	GUD1	Q07729	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SUP45	YBR143C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SUP45	YBR143C	THI73	Q07904	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SUP45	YBR143C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SUP45	YBR143C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SUP45	YBR143C	MMS22	Q06164	1454 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SUP45	YBR143C	AIM14	P53109	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SUP45	YBR143C	MET13	P53128	600 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SUP45	YBR143C	CTF4	Q01454	927 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SUP45	YBR143C	THI21	Q08975	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SUP45	YBR143C	TRM13	Q12383	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SUP45	YBR143C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	YGR237C	P50089	785 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	PKH1	Q03407	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	ATG33	Q06485	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	ATG2	P53855	1592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
SUP45	YBR143C	ERG4	P25340	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	MGS1	P40151	587 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	VHR1	P40522	640 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	YBP2	P53169	641 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	UME1	Q03010	460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	POL1	P13382	1468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	HMG1	P12683	1054 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	CTF13	P35203	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	SUL1	P38359	859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	BNA2	P47125	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	ORC4	P54791	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	TAF2	P23255	1407 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	YKR051W	P36142	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	KTR4	P38131	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	YEN1	P40028	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	TRM11	Q12463	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	UBP12	P39538	1254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	PFA3	P42836	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	BFA1	P47113	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	MRPS35	P53292	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	ASI2	P53895	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	HFD1	Q04458	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	BUD4	P47136	1447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	STU1	P38198	1513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	GRX4	P32642	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	KOG1	P38873	1557 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	CKB2	P38930	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUP45	YBR143C	DNA2	P38859	1522 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	TDA3	P38758	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	RPP1	P38786	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	FKH2	P41813	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	YJR096W	P47137	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	YLR415C	O13578	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	ALG7	P07286	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	MIH1	P23748	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	YKR018C	P36114	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	MOH1	P38191	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	PCL10	P53124	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	RNT1	Q02555	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	NRG1	Q03125	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	PEP1	P32319	1579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	ECM5	Q03214	1411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	OAR1	P35731	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	YKR075C	P36155	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	APT2	P36973	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	YBR259W	P38338	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	RET2	P43621	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	YGR153W	P48238	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	ASM4	Q05166	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	BPT1	P14772	1559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	MET3	P08536	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	MNN4	P36044	1178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	ELO3	P40319	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	MUP1	P50276	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	DLT1	Q04216	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	FRE5	Q08908	694 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	MAL31	P38156	614 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SUP45	YBR143C	STB4	P50104	949 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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