RNA–Protein interactions for RNA: YBL038W

MRPL16, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL16, Length 699 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL16	YBL038W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	TAD1	P53065	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	DAM1	P53267	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	MUK1	Q02866	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	SAK1	P38990	1142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	SSY5	P47002	699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	RSC3	Q06639	885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	YPT53	P36019	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	PPS1	P38148	807 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	YJL049W	P47048	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	MUP1	P50276	574 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	ASI2	P53895	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	YML122C	Q03207	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	FLC1	Q08967	793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	EMC3	P36039	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	YHL017W	P38745	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	SHR5	P41912	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	AMA1	P50082	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	REH1	Q06709	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	IRC10	Q08118	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	PDR10	P51533	1564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
MRPL16	YBL038W	SPC42	P36094	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	MRPS35	P53292	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	GND2	P53319	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	NRG1	Q03125	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	TAF8	Q03750	510 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	ADY4	Q05955	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL16	YBL038W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	YCL002C	P25565	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	MTH1	P35198	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	GYP8	P43570	497 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	ALG2	P43636	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	YJL163C	P46996	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	HUL5	P53119	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	YLR415C	O13578	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	SDS3	P40505	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	YIR042C	P40586	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	PFA3	P42836	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	DIF1	O13577	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	GAL11	P19659	1081 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	MET7	Q08645	548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	BUD3	P25558	1636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	CAN1	P04817	590 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	CDC43	P18898	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	BET3	P36149	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	PCL5	P38794	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	RIA1	P53893	1110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	MLP2	P40457	1679 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	YBR053C	P38235	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	YBP2	P53169	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	PER1	P25625	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	ALY2	P47029	1046 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	ATP25	Q03153	612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	IRC13	Q08630	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	THI21	Q08975	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL16	YBL038W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	SPC29	P33419	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	YBR259W	P38338	688 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	YAP3	P38749	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	ATF1	P40353	525 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	ZIP2	P53061	704 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	GAD1	Q04792	585 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	TGL5	Q12043	749 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	KIN3	P22209	435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MRPL16	YBL038W	RTA1	P53047	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.6 ms