RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623691.3

GPS1-226, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene GPS1, Length 1,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-226ENST00000623691 CUL4AQ13619 759 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 ITGA6P23229 1130 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 SUSD4Q5VX71 490 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 SMIM5Q71RC9 77 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 TMX3Q96JJ7 454 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 TTC14Q96N46 770 aa20.3■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 PHF14O94880 888 aa20.29■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.28■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.28■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 LRP5O75197 1615 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 CHGBP05060 677 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GPS1-226ENST00000623691 SPEF2Q9C093 1822 aa20.27■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 ADORA1P30542 326 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.26■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 PARP10Q53GL7 1025 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 FAM177BA6PVY3 158 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 GOLIM4O00461 696 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 TAF5LO75529 589 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 XAGE2Q96GT9 111 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.25■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.24■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 RGL2O15211 777 aa20.24■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 BAG6P46379 1132 aa20.24■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.24■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.24■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.24■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 ZPR1O75312 459 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 NTSR2O95665 410 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 SSFA2P28290 1259 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 RFC4P35249 363 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 METTL24Q5JXM2 366 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 NARFQ9UHQ1 456 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 NUCB2P80303 420 aa20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 ABCC12Q96J65 1359 aa20.22■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 SLC27A2O14975 620 aa20.22■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 CPA1P15085 419 aa20.22■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 ADRA2BP18089 450 aa20.22■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.22■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.22■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 LAMB2P55268 1798 aa20.21■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 KCNJ4P48050 445 aa20.21■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 GSE1Q14687 1217 aa20.21■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 ATP2B3Q16720 1220 aa20.21■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 ZNF827Q17R98 1081 aa20.21■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.21■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.21■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.21■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 RTL9Q8NET4 1388 aa20.21■□□□□ 0.83
GPS1-226ENST00000623691 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GPS1-226ENST00000623691 AK2P54819 239 aa20.2■□□□□ 0.82
GPS1-226ENST00000623691 GORABQ5T7V8 394 aa20.2■□□□□ 0.82
GPS1-226ENST00000623691 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.2■□□□□ 0.82
GPS1-226ENST00000623691 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.2■□□□□ 0.82
GPS1-226ENST00000623691 PKP1Q13835 747 aa20.2■□□□□ 0.82
GPS1-226ENST00000623691 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.2■□□□□ 0.82
GPS1-226ENST00000623691 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.2■□□□□ 0.82
GPS1-226ENST00000623691 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.2■□□□□ 0.82
GPS1-226ENST00000623691 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
GPS1-226ENST00000623691 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms