RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
ATP9B-223	ENST00000590608	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ATP9B-223	ENST00000590608	C12orf49	Q9H741	205 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ATP9B-223	ENST00000590608	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
ATP9B-223	ENST00000590608	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		7.59	□□□□□ -1.19
ATP9B-223	ENST00000590608	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	PHACTR2	O75167	634 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	NEFL	P07196	543 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	CTBS	Q01459	385 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	TNP2	Q05952	138 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	ELP3	Q9H9T3	547 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	PHF24	Q9UPV7	400 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	EREG	O14944	169 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	BCR	P11274	1271 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	CNTN3	Q9P232	1028 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	USP17L7	P0C7H9	530 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	MAP2K3	P46734	347 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	KCNQ4	P56696	695 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	USP48	Q86UV5	1035 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	CEP63	Q96MT8	703 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	STRN4	Q9NRL3	753 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	OIP5	O43482	229 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	XYLB	O75191	536 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	CD33	P20138	364 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	MAP3K10	Q02779	954 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	XKR5	Q6UX68	686 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	GGT7	Q9UJ14	662 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	BMP4	P12644	408 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	KCNMA1	Q12791	1236 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	LAMC2	Q13753	1193 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	BCO2	Q9BYV7	579 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	BRD7	Q9NPI1	651 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608		F6X3S4	739 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	COPRS	Q9NQ92	184 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATP9B-223	ENST00000590608	USP31	Q70CQ4	1352 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM182B	Q5T319	152 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	DPH6	Q7L8W6	267 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	KLF15	Q9UIH9	416 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	ATP2B1	P20020	1258 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GRM2	Q14416	872 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	SASH3	O75995	380 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	ARAF	P10398	606 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	EPB42	P16452	691 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	LNPK	Q9C0E8	428 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ATP9B-223	ENST00000590608	GIPC1	O14908	333 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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