RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585645.5

GTF3C2-AS1-203, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 422 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PIK3R4Q99570 1358 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 WASHC4Q2M389 1173 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RNF135Q8IUD6 432 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SLIT2O94813 1529 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PIK3R2O00459 728 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MSX1P28360 303 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SOX11P35716 441 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PHKA2P46019 1235 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 IRF5Q13568 498 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FAM182BQ5T319 152 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KIF1BO60333 1816 aa6.34□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 INHAP05111 366 aa6.34□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TLR1Q15399 786 aa6.34□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.34□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.34□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NLRP8Q86W28 1048 aa6.34□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.34□□□□□ -1.39
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.33□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RUBCNLQ9H714 662 aa6.33□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.33□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CLTCL1P53675 1640 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 BNIP3LO60238 219 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PROCP04070 461 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ITGB2P05107 769 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ARAFP10398 606 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 BMP4P12644 408 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FGFR3P22607 806 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SCNN1DP51172 638 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 GDF10P55107 478 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 IFT172Q9UG01 1749 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SBF2Q86WG5 1849 aa6.32□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CASZ1Q86V15 1759 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MYOM1P52179 1685 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ADAM23O75077 832 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SMTNP53814 917 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PPLO60437 1756 aa6.31□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 C2CD2LO14523 706 aa6.3□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 MTFR1Q15390 333 aa6.3□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.3□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.3□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.3□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ADGRL2O95490 1459 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CDK2AP1O14519 115 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 FOXO3O43524 673 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 EPXP11678 715 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ATP4AP20648 1035 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 BAG6P46379 1132 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 PLA2G4AP47712 749 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 VAC14Q08AM6 782 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 SEMA3FQ13275 785 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 GGA1Q9UJY5 639 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 GNB5O14775 395 aa6.28□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 CTBSQ01459 385 aa6.28□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 RRAGCQ9HB90 399 aa6.28□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.28□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KIF1AQ12756 1690 aa6.27□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.27□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 KRBA1A5PL33 1030 aa6.27□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 A6NJY4 79 aa6.27□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-203ENST00000585645 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms