RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 ARTNQ5T4W7 220 aa7.77□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.77□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 ATF3P18847 181 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 CHSY3Q70JA7 882 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 USP32Q8NFA0 1604 aa7.76□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 PXDNQ92626 1479 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 BNIP3LO60238 219 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L8P0C7I0 530 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 CENPCQ03188 943 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 EFHC2Q5JST6 749 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 NBPF11Q86T75 865 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 NRAPQ86VF7 1730 aa7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 PPLO60437 1756 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 ARAFP10398 606 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 MSX1P28360 303 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 TICAM2Q86XR7 235 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 CNKSR1Q969H4 720 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 ZMYND15Q9H091 742 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 TBX22Q9Y458 520 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 PIK3R4Q99570 1358 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 IFT172Q9UG01 1749 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 TRAK2O60296 914 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 IL2RAP01589 272 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC125Q86Z20 511 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 PLVAPQ9BX97 442 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 RALGAPBQ86X10 1494 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 KIF1BO60333 1816 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 PTCH1Q13635 1447 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 ZBBXA8MT70 800 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 GNASQ5JWF2 1037 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 RNF20Q5VTR2 975 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM11Q96F44 468 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 ORAI2Q96SN7 254 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-209ENST00000561136 DYRK3O43781 588 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 C4orf17Q53FE4 359 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 USP21Q9UK80 565 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.7□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 CLSTN1O94985 981 aa7.7□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 NGLY1Q96IV0 654 aa7.7□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa7.7□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 KNDC1Q76NI1 1749 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 RAD21O60216 631 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 GNRH1P01148 92 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 FBXO45P0C2W1 286 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 SLIT2O94813 1529 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 ADH6P28332 368 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 PSMD1Q99460 953 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 KLF15Q9UIH9 416 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 KIF1AQ12756 1690 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 PRAG1Q86YV5 1406 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-209ENST00000561136 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms