RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 A0A1B0GUL7 405 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 TIMM10P62072 90 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 CASC1Q6TDU7 716 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 EP400Q96L91 3159 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 SEC24BO95487 1268 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 CNTROBQ8N137 903 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 ATP2B3Q16720 1220 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 MSL1Q68DK7 614 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 AK9Q5TCS8 1911 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 ATP5JP18859 108 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 GORABQ5T7V8 394 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 PDE8BO95263 885 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 COL4A1P02462 1669 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 MMP10P09238 476 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 XAGE2Q96GT9 111 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 TAF1P21675 1872 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRR-209ENST00000549308 SLC5A1P13866 664 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 ADORA1P30542 326 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 CHRNDQ07001 517 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 TAF5LO75529 589 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 LPIN2Q92539 896 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 EVI5LQ96CN4 794 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 GRAPQ13588 217 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 A0A1B0GUL6 1792 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 FGFR2P21802 821 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 CHMLP26374 656 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 HAUS7Q99871 368 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 CRY2Q49AN0 593 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 FSD1Q9BTV5 496 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 PDE6BP35913 854 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 SNAP23O00161 211 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 HIP1O00291 1037 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 KCNJ4P48050 445 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRR-209ENST00000549308 GOLIM4O00461 696 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 UBE4AQ14139 1066 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC102BQ68D86 513 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 REC8O95072 547 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 PHKA1P46020 1223 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 SNRKQ9NRH2 765 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 BBOX1O75936 387 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 NPR1P16066 1061 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 ZAP70P43403 619 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 SCARF1Q14162 830 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRR-209ENST00000549308 SRGNP10124 158 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms