RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 SYNE4Q8N205 404 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 RAD50Q92878 1312 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 CBX1P83916 185 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
TRPS1-208ENST00000519076 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 PTH1RQ03431 593 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF11Q86T75 865 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 TIGD1Q96MW7 591 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 HLFQ16534 295 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 IL25Q9H293 177 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0D9SFI3 127 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ITGA6P23229 1130 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 PKP1Q13835 747 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ATP2B3Q16720 1220 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 RGPD5Q99666 1765 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 HSPA4P34932 840 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 AK2P54819 239 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 PLCB2Q00722 1185 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 SATB1Q01826 763 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 RASEFQ8IZ41 740 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 TTC36A6NLP5 189 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 H7C1W4 665 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 SIK1P57059 783 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 NECAB1Q8N987 351 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 KIF3AQ9Y496 699 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 H3BQV1 296 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 IRF6O14896 467 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 IFFO2Q5TF58 517 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CREB3L3Q68CJ9 461 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 FIBPO43427 364 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 PPFIA3O75145 1194 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 HAND2P61296 217 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 SEMA3FQ13275 785 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CEP83Q9Y592 693 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CACNA1FO60840 1977 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ATP5JP18859 108 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 TRDNQ13061 729 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 FERMT3Q86UX7 667 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 TULP2O00295 520 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 KCNQ2O43526 872 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB9Q96C00 473 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 GREM2Q9H772 168 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ABCF2Q9UG63 623 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ZPR1O75312 459 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 XAGE2Q96GT9 111 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 KRT32Q14532 448 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 NLRP10Q86W26 655 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 DDX11Q96FC9 970 aa9.23□□□□□ -0.93
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