RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489694.5

RARB-208, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene RARB, Length 574 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-208ENST00000489694 TTC9Q92623 222 aa6.19□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 EGFRP00533 1210 aa6.18□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 OCLNQ16625 522 aa6.18□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.18□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.18□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.18□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.17□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 OPLAHO14841 1288 aa6.17□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 LRP8Q14114 963 aa6.17□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 TREML1Q86YW5 311 aa6.17□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.17□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.17□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 USP20Q9Y2K6 914 aa6.17□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 SYNJ1O43426 1573 aa6.17□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 PRMT3O60678 531 aa6.16□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 XYLBO75191 536 aa6.16□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 NOS3P29474 1203 aa6.16□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.16□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.16□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 SLAIN2Q9P270 581 aa6.16□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 KIF27Q86VH2 1401 aa6.16□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.15□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 DLL1O00548 723 aa6.15□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 COX20Q5RI15 118 aa6.15□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.15□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 PLD4Q96BZ4 506 aa6.15□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.15□□□□□ -1.42
RARB-208ENST00000489694 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.15□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 CUX1P39880 1505 aa6.15□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.14□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 KIF21BO75037 1637 aa6.14□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 PSAPP07602 524 aa6.14□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 SOX18P35713 384 aa6.14□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.14□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 GOLGA3Q08378 1498 aa6.14□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.14□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.13□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 MMP20O60882 483 aa6.13□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 SIK1P57059 783 aa6.13□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 NBPF11Q86T75 865 aa6.13□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.13□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.13□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 J3QW42 95 aa6.12□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 SOGA1O94964 1423 aa6.12□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 GHRHP01286 108 aa6.12□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.12□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.12□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.11□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 C16orf46Q6P387 395 aa6.11□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.11□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 COL26A1Q96A83 441 aa6.11□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.11□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.11□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 RBSNQ9H1K0 784 aa6.11□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 WDR97A6NE52 1622 aa6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 TOPBP1Q92547 1522 aa6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 PRXQ9BXM0 1461 aa6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 F8W735 103 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 NLRP13Q86W25 1043 aa6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 RNF112Q9ULX5 631 aa6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.1□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.09□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.09□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 TNFRSF10BO14763 440 aa6.09□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 SETDB1Q15047 1291 aa6.09□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 FAM26DQ5JW98 314 aa6.09□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 Q6ZS46 218 aa6.09□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.09□□□□□ -1.43
RARB-208ENST00000489694 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.09□□□□□ -1.44
RARB-208ENST00000489694 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.08□□□□□ -1.44
RARB-208ENST00000489694 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RARB-208ENST00000489694 ALX3O95076 343 aa6.08□□□□□ -1.44
RARB-208ENST00000489694 ATP2B4P23634 1241 aa6.08□□□□□ -1.44
RARB-208ENST00000489694 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RARB-208ENST00000489694 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.08□□□□□ -1.44
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