RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 FGD1P98174 961 aa18.12■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 LRRN4CLQ8ND94 238 aa18.12■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa18.12■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 BABAM1Q9NWV8 329 aa18.12■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.12■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 SASH1O94885 1247 aa18.11■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 TERF2Q15554 542 aa18.11■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 GORABQ5T7V8 394 aa18.11■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 KRT222Q8N1A0 295 aa18.11■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.11■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 ERBB3P21860 1342 aa18.11■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 VGLL3A8MV65 326 aa18.11■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 USP54Q70EL1 1684 aa18.11■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 RESTQ13127 1097 aa18.1■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 RNF20Q5VTR2 975 aa18.1■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 Q6ZUG5 572 aa18.1■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.1■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.1■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 RGPD5Q99666 1765 aa18.1■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 SYCP1Q15431 976 aa18.1■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 GTF3C6Q969F1 213 aa18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 ANKRD1Q15327 319 aa18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 ADCY9O60503 1353 aa18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 MYL6BP14649 208 aa18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 CCZ1BP86790 482 aa18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 SUCLG2Q96I99 432 aa18.09■□□□□ 0.49
SFRP4-201ENST00000436072 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.07■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 NYAP1Q6ZVC0 841 aa18.07■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 STX1AQ16623 288 aa18.07■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF446Q9NWS9 450 aa18.07■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 BIN1O00499 593 aa18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 ME1P48163 572 aa18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 ISM2Q6H9L7 571 aa18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 USP28Q96RU2 1077 aa18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM51Q9NW97 253 aa18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 SMC2O95347 1197 aa18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 SCRN1Q12765 414 aa18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 NEK1Q96PY6 1258 aa18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 PTPN21Q16825 1174 aa18.05■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa18.05■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 CHST3Q7LGC8 479 aa18.05■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 CACNA1FO60840 1977 aa18.05■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 KINO60870 393 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 TAF5LO75529 589 aa18.05■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 FSIP1Q8NA03 581 aa18.05■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 ZBTB9Q96C00 473 aa18.05■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa18.05■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 CFAP45Q9UL16 551 aa18.05■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 CDC25BP30305 580 aa18.04■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.04■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 ERO1AQ96HE7 468 aa18.04■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 KAZALD1Q96I82 304 aa18.04■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.04■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 APOBRQ0VD83 1088 aa18.03■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 TMC6Q7Z403 805 aa18.03■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 SDF4Q9BRK5 362 aa18.03■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 SLIT3O75094 1523 aa18.03■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.03■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 A0A1B0GVL5 298 aa18.03■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 HIP1O00291 1037 aa18.03■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.03■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 HOXB7P09629 217 aa18.03■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 MST1RQ04912 1400 aa18.02■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 A0A0G2JLW4 131 aa18.02■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF790Q6PG37 636 aa18.02■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 SARM1Q6SZW1 724 aa18.02■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 KLHL34Q8N239 644 aa18.02■□□□□ 0.48
SFRP4-201ENST00000436072 COL15A1P39059 1388 aa18.02■□□□□ 0.47
SFRP4-201ENST00000436072 IFNKQ9P0W0 207 aa18.02■□□□□ 0.47
SFRP4-201ENST00000436072 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
SFRP4-201ENST00000436072 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SFRP4-201ENST00000436072 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SFRP4-201ENST00000436072 CYP21A2P08686 494 aa18.01■□□□□ 0.47
SFRP4-201ENST00000436072 MTX1Q13505 466 aa18.01■□□□□ 0.47
SFRP4-201ENST00000436072 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms