RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429747.5

CPNE4-201, Transcript of copine 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPNE4, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4-201ENST00000429747 HOXB7P09629 217 aa14.66□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.66□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 SMARCE1Q969G3 411 aa14.66□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 DNAI1Q9UI46 699 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 NLRP1Q9C000 1473 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 ZSCAN12O43309 604 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 GPTP24298 496 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 SYKP43405 635 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 NAPBQ9H115 298 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 IFNKQ9P0W0 207 aa14.65□□□□□ -0.06
CPNE4-201ENST00000429747 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 NR1I2O75469 434 aa14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 NCOA7Q8NI08 942 aa14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 MED14O60244 1454 aa14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 SPTLC2O15270 562 aa14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ADGRB3O60242 1522 aa14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 UBASH3AP57075 661 aa14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 KRT222Q8N1A0 295 aa14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 TBX22Q9Y458 520 aa14.64□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 TNNI3KQ59H18 835 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 CAGE1Q8TC20 777 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 PRC1O43663 620 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ALG1Q9BT22 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ABCF2Q9UG63 623 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.63□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 NEO1Q92859 1461 aa14.62□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.62□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 PROSER3Q2NL68 480 aa14.62□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 SIRT1Q96EB6 747 aa14.62□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.62□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 GNG11P61952 73 aa14.62□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.62□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 CCDC102BQ68D86 513 aa14.62□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.62□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.62□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 RXRAP19793 462 aa14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 CASQ1P31415 396 aa14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ZNF790Q6PG37 636 aa14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 WASF1Q92558 559 aa14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.61□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 AK7Q96M32 723 aa14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 TXLNAP40222 546 aa14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 GCKRQ14397 625 aa14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 MAP4K1Q92918 833 aa14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 GTF3C6Q969F1 213 aa14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 RAI14Q9P0K7 980 aa14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ZBTB9Q96C00 473 aa14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 RAD21O60216 631 aa14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CPNE4-201ENST00000429747 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms