RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.14□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 ALDH1B1P30837 517 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 PROSER3Q2NL68 480 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 SUSD4Q5VX71 490 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 RTKN2Q8IZC4 609 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 CACNA1SQ13698 1873 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 TRIM66O15016 1216 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 GPR153Q6NV75 609 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 SLC51AQ86UW1 340 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 PSMD1Q99460 953 aa9.13□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 COL4A5P29400 1685 aa9.12□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 A6NJR5 290 aa9.12□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 PPP1R37O75864 691 aa9.12□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 ANXA1P04083 346 aa9.12□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.12□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 IQCA1LA6NCM1 817 aa9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 FZD9O00144 591 aa9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 CHL1O00533 1208 aa9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 KRT24Q2M2I5 525 aa9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 PARP10Q53GL7 1025 aa9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 SYNE4Q8N205 404 aa9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 NUP98P52948 1817 aa9.11□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 E9PSI1 815 aa9.1□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 LDHDQ86WU2 507 aa9.1□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.1□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 PASKQ96RG2 1323 aa9.1□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.1□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.1□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.1□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 RUNDC1Q96C34 613 aa9.1□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 COPS6Q7L5N1 327 aa9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 NLRP10Q86W26 655 aa9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 GPC2Q8N158 579 aa9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 HACL1Q9UJ83 578 aa9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.09□□□□□ -0.95
CTXN3-201ENST00000379445 SCN4AP35499 1836 aa9.08□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 ABCC4O15439 1325 aa9.08□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 HOXB7P09629 217 aa9.08□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 EPHX2P34913 555 aa9.08□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.08□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 FBXW7Q969H0 707 aa9.08□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 NLRP3Q96P20 1036 aa9.08□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.08□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 TCIRG1Q13488 830 aa9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 JDP2Q8WYK2 163 aa9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 LTBP1Q14766 1721 aa9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 SCNN1DP51172 638 aa9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.07□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 CNTNAP1P78357 1384 aa9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF853P0CG23 659 aa9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 PPIP5K2O43314 1243 aa9.05□□□□□ -0.96
CTXN3-201ENST00000379445 AOC3Q16853 763 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms