RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TCHPQ9BT92 498 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 PNMA2Q9UL42 364 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 PIK3R4Q99570 1358 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 DEUP1Q05D60 604 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 IFNL2Q8IZJ0 200 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 VCXQ9H320 206 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 MNAT1P51948 309 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 MAP3K9P80192 1104 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC174Q6PII3 467 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 SLU7O95391 586 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CALM1P0DP23 149 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CALM2P0DP24 149 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CALM3P0DP25 149 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CDC25BP30305 580 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 NEK4P51957 841 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 MAIP1Q8WWC4 291 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 FAM135BQ49AJ0 1406 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 NFE2L2Q16236 605 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC14Q49A88 953 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 POLD1P28340 1107 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 SULT6B1Q6IMI4 303 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 RUFY4Q6ZNE9 571 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 HYPKQ9NX55 129 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 GNAT2P19087 354 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ERCC3P19447 782 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 MSANTD4Q8NCY6 345 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 FAM81BQ96LP2 452 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 FAN1Q9Y2M0 1017 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 COG6Q9Y2V7 657 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 PLA2R1Q13018 1463 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 NOS1P29475 1434 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC69A6NI79 296 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 KRT86O43790 486 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 SNX16P57768 344 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 BRD3Q15059 726 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 EFCC1Q9HA90 598 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 SPECC1Q5M775 1068 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 MAGEF1Q9HAY2 307 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 PDRG1Q9NUG6 133 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 USP32Q8NFA0 1604 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 HMOX1P09601 288 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 HOXB7P09629 217 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CEP135Q66GS9 1140 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 MYOM2P54296 1465 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TCP11L2Q8N4U5 519 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC114Q96M63 670 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 FOXP2O15409 715 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TSC1Q92574 1164 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 STIM2Q9P246 746 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ME1P48163 572 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 FSD2A1L4K1 749 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 VPS53Q5VIR6 699 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CALML3P27482 149 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms