RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262124.15

SEH1L-201, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 3,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-201ENST00000262124 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 JAG2Q9Y219 1238 aa14.54□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 COL15A1P39059 1388 aa14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 BRD1O95696 1058 aa14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 ATP2B3Q16720 1220 aa14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 HIP1O00291 1037 aa14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 TOMM22Q9NS69 142 aa14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 COL18A1P39060 1754 aa14.53□□□□□ -0.08
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SEH1L-201ENST00000262124 APOBRQ0VD83 1088 aa14.53□□□□□ -0.08
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SEH1L-201ENST00000262124 USP54Q70EL1 1684 aa14.53□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 MRE11P49959 708 aa14.52□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.52□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.52□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.52□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.52□□□□□ -0.08
SEH1L-201ENST00000262124 PHF14O94880 888 aa14.52□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 OSBP2Q969R2 916 aa14.52□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.52□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.51□□□□□ -0.09
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SEH1L-201ENST00000262124 M0R2C6 588 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 RXRAP19793 462 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 SIK1P57059 783 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 ZNF609O15014 1411 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 STRCQ7RTU9 1775 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 PSMA5P28066 241 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 SUSD4Q5VX71 490 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 INCENPQ9NQS7 918 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 PHKA1P46020 1223 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 ITPK1Q13572 414 aa14.51□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 ST3GAL1Q11201 340 aa14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 CAMK4Q16566 473 aa14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 RBSNQ9H1K0 784 aa14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 ABCF2Q9UG63 623 aa14.5□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 FSD2A1L4K1 749 aa14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 RPS6KB1P23443 525 aa14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 FBXW7Q969H0 707 aa14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 CTSWP56202 376 aa14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 MAST3O60307 1309 aa14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 H3BQV1 296 aa14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 IFFO2Q5TF58 517 aa14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.49□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 MCAMP43121 646 aa14.48□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.48□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.47□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.47□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 ERBB4Q15303 1308 aa14.47□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 F13A1P00488 732 aa14.47□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.47□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 TCHHQ07283 1943 aa14.47□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.46□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 BCAMP50895 628 aa14.46□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.46□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 SLC51AQ86UW1 340 aa14.46□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SEH1L-201ENST00000262124 MTMR6Q9Y217 621 aa14.46□□□□□ -0.1
SEH1L-201ENST00000262124 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.46□□□□□ -0.1
SEH1L-201ENST00000262124 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
SEH1L-201ENST00000262124 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.45□□□□□ -0.1
SEH1L-201ENST00000262124 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
SEH1L-201ENST00000262124 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.45□□□□□ -0.1
SEH1L-201ENST00000262124 E7EWF7 191 aa14.45□□□□□ -0.1
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