RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 CBX8Q9HC52 389 aa21.68■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.68■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 PIK3C2AO00443 1686 aa21.68■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 A1BGP04217 495 aa21.68■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 COPRSQ9NQ92 184 aa21.68■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.68■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 PXDNQ92626 1479 aa21.67■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 GTF3C6Q969F1 213 aa21.67■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.67■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.67■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.67■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 EVA1CP58658 441 aa21.66■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.66■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.062e-7■■□□□ 12.9
LRP3-201ENST00000253193 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.66■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.65■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.65■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.65■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 STK38Q15208 465 aa21.65■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 IL17RAQ96F46 866 aa21.65■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 A0A087WWV3 80 aa21.64■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
LRP3-201ENST00000253193 SCRN1Q12765 414 aa21.64■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.64■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.64■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.64■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 LRMPQ12912 555 aa21.64■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 FSIP1Q8NA03 581 aa21.64■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.64■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 TOMM22Q9NS69 142 aa21.64■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.63■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.63■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 LRRC24Q50LG9 513 aa21.63■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.63■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 CYP27B1O15528 508 aa21.63■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.63■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.63■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 HAUS7Q99871 368 aa21.62■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 TRDNQ13061 729 aa21.62■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 A0A1B0GUL7 405 aa21.62■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.62■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.61■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 ATP2B3Q16720 1220 aa21.61■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 SLIT1O75093 1534 aa21.6■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.6■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 BIN1O00499 593 aa21.6■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 GPTP24298 496 aa21.6■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 PGBD1Q96JS3 809 aa21.6■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 IGSF3O75054 1194 aa21.59■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.59■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 KCNB2Q92953 911 aa21.59■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 NWD1Q149M9 1564 aa21.59■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.59■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.59■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.58■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 ELP1O95163 1332 aa21.58■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.58■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 SMC2O95347 1197 aa21.58■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 ISM2Q6H9L7 571 aa21.58■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 C8orf76Q96K31 380 aa21.58■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.58■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 TNNT1P13805 278 aa21.58■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.58■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
LRP3-201ENST00000253193 NCAPD2Q15021 1401 aa21.58■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 E7EWF7 191 aa21.58■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 USP28Q96RU2 1077 aa21.58■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.58■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.58■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 UTYO14607 1347 aa21.57■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 EYA2O00167 538 aa21.57■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 FAM89AQ96GI7 184 aa21.57■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.57■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 A0A0G2JLW4 131 aa21.57■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.57■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.57■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.57■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 METTL24Q5JXM2 366 aa21.56■■□□□ 1.04
LRP3-201ENST00000253193 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms