RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000204026.2

Ttll3-206, Transcript of Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttll3, Length 1,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Oog3Q3UWY1 500 aa16.78■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Trappc12Q8K2L8 797 aa16.78■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa16.78■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Greb1lB9EJV3 1913 aa16.78■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa16.78■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Scn11aQ9R053 1765 aa16.77■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 SisF8VQM5 1818 aa16.77■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Il15P48346 162 aa16.77■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Csrnp1P59054 583 aa16.77■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Bend4P86174 541 aa16.77■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Ksr2Q3UVC0 959 aa16.77■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Tll1Q62381 1013 aa16.77■□□□□ 0.28
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Traf5P70191 558 aa16.76■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Gas2l2Q5SSG4 860 aa16.76■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Mxd3Q80US8 206 aa16.76■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Znf18Q810A1 556 aa16.76■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Polr3glQ8R0C0 218 aa16.76■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Sirt2Q8VDQ8 389 aa16.76■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Heg1E9Q7X6 1337 aa16.76■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Ube4aE9Q735 1028 aa16.75■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Zap70P43404 618 aa16.75■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Znf496Q5SXI5 585 aa16.75■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Casp1P29452 402 aa16.74■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Lman1lQ8VCD3 505 aa16.74■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Mageb2A2AHM0 380 aa16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Usp17ldG5E8G2 545 aa16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Usp17lcG5E8I7 545 aa16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 NudcO35685 332 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 MycnP03966 462 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Aifm3Q3TY86 605 aa16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Kcnc4Q8R1C0 628 aa16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Snap47Q8R570 413 aa16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Rnf181Q9CY62 165 aa16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Vamp4O70480 141 aa16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Pde4aO89084 844 aa16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Pbx4Q99NE9 378 aa16.73■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Usp17lbE9Q9U0 468 aa16.72■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Prkg1P0C605 671 aa16.72■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Jarid2Q62315 1234 aa16.72■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Fchsd1Q6PFY1 688 aa16.72■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 NrapQ80XB4 1728 aa16.71■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Skint7A7XV04 395 aa16.71■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Nectin2P32507 530 aa16.71■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 NexnQ7TPW1 607 aa16.71■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Pxylp1Q8BHA9 480 aa16.71■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Tmem143Q8VD26 458 aa16.71■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Ndfip2Q91ZP6 311 aa16.71■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Chl1P70232 1209 aa16.7■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Rgs19Q9CX84 216 aa16.7■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Sh3bp5Q9Z131 463 aa16.7■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Ccdc51Q3URS9 406 aa16.69■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 LdhdQ7TNG8 484 aa16.69■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Itgb7P26011 806 aa16.68■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Akap4Q60662 849 aa16.68■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Kbtbd13Q8C828 458 aa16.68■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Hdac9Q99N13 588 aa16.68■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 EhhadhQ9DBM2 718 aa16.68■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Wnt10bP48614 389 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Slc38a10Q5I012 1090 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 HellsQ60848 821 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Slain1Q68FF7 579 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Bend3Q6PAL0 825 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Tmco5bQ80X59 307 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Ccdc60Q8C4J0 545 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Lysmd1Q9D0E3 226 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Phrf1A6H619 1682 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Epc2Q8C0I4 808 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Smc4Q8CG47 1286 aa16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Bin2D3Z6Q9 489 aa16.66■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Irf6P97431 467 aa16.66■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Gnat3Q3V3I2 354 aa16.66■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 GpkowQ56A08 488 aa16.66■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Ralbp1Q62172 648 aa16.66■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Ofd1Q80Z25 1017 aa16.66■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Slc44a4Q91VA1 707 aa16.66■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Osbpl5Q9ER64 874 aa16.66■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Peak1Q69Z38 1735 aa16.65■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Grm8P47743 908 aa16.65■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Adam39Q7M762 756 aa16.65■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Rtp1Q8C8C1 263 aa16.65■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Chmp3Q9CQ10 224 aa16.65■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Glrx3Q9CQM9 337 aa16.65■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Bcs1lQ9CZP5 418 aa16.65■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Tmem79Q9D709 391 aa16.65■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Ifi207E9Q3L4 978 aa16.64■□□□□ 0.25
Ttll3-206ENSMUST00000204026 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49 ms