RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dpf1Q9QX66 387 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zkscan16A2ALW2 728 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prr5lA2AVJ5 370 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 1700006A11RikB9EHI3 544 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2c68K7N6C2 491 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb38Q3LR78 1197 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SowahdQ8BY98 327 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ttc19Q8CC21 365 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ube2q2Q8K2Z8 378 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Erc1Q99MI1 1120 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arap2Q8BZ05 1703 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Catsper2A2ARP9 588 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ms4a2P20490 235 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Neurod6P48986 337 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Filip1lQ6P6L0 1131 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 B4galnt4Q766D5 1034 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Clca2Q8BG22 942 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Amhr2Q8K592 568 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bmp2kQ91Z96 1138 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Riok1Q922Q2 567 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc7Q9D541 371 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hmg20bQ9Z104 317 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nphp3Q7TNH6 1325 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxl16A2RT62 479 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cops6O88545 324 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MecomP14404 1042 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp19a1P28649 503 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TrhQ62361 256 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atg9aQ68FE2 551 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Esco1Q69Z69 843 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt25Q8VCW2 446 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tktl2Q9D4D4 627 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Foxo4Q9WVH3 505 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col4a1P02463 1669 aa11.11□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plbd2Q3TCN2 594 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DbnlQ62418 436 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slf2Q6P9P0 1278 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Asap2Q7SIG6 958 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 St18Q80TY4 1045 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prune1Q8BIW1 454 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SnrkQ8VDU5 748 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb1Q91VL9 713 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chmp3Q9CQ10 224 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plekho1Q9JIY0 408 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnq5Q9JK45 933 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ank1Q02357 1862 aa11.1□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TsksO54887 585 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rtkn2Q14B46 604 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ifit2Q64112 472 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gimap8Q75N62 688 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abtb2Q7TQI7 1024 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ubxn10Q8BG34 277 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Jakmip1Q8BVL9 626 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nek11Q8C0Q4 628 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdlim2Q8R1G6 349 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stk3Q9JI10 497 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Add2Q9QYB8 725 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 UtrnE9Q6R7 3430 aa11.09□□□□□ -0.63
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ssc5dQ8BV57 1371 aa11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vwa3bJ9JI28 736 aa11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Npy5rO70342 466 aa11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hspa2P17156 633 aa11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ftl2P49945 183 aa11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 IarsQ8BU30 1262 aa11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ift57Q8BXG3 429 aa11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adam1bQ8R534 806 aa11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trip6Q9Z1Y4 480 aa11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col24a1Q30D77 1733 aa11.08□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cfap70D3YVL2 1141 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ets1P27577 440 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rfx1P48377 963 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp1b3P97370 278 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NogP97466 232 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RubcnlQ3TD16 648 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Il17raQ60943 864 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kiaa0753Q6A000 959 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam160b2Q80YR2 744 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atf7Q8R0S1 413 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Antxr1Q9CZ52 562 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.8 ms