RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Limch1Q3UH68 1057 aa26.04■■□□□ 1.76
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sos2Q02384 1333 aa25.98■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TrdnE9Q9K5 693 aa25.97■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdhb15Q91Y04 786 aa25.97■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igflr1Q3U4N7 345 aa25.97■■□□□ 1.75
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Txnrd1Q9JMH6 613 aa25.97■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eya2O08575 532 aa25.96■■□□□ 1.75
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krt25Q8VCW2 446 aa25.96■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc4a1P04919 929 aa25.96■■□□□ 1.75
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prl3d2F6R3P9 224 aa25.95■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Col18a1P39061 1774 aa25.95■■□□□ 1.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa25.95■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttc19Q8CC21 365 aa25.95■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mtmr3Q8K296 1196 aa25.95■■□□□ 1.74
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tsen34Q8BMZ5 316 aa25.94■■□□□ 1.74
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 BrapQ99MP8 591 aa25.94■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hmgn5Q9JL35 406 aa25.94■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tpd52l1O54818 204 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hand2Q61039 217 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem67Q8BR76 992 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AidaQ8C4Q6 305 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Osbpl5Q9ER64 874 aa25.93■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adam1aQ60813 791 aa25.92■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spty2d1Q68FG3 682 aa25.92■■□□□ 1.74
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gsdma2Q32M21 443 aa25.92■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem109Q3UBX0 243 aa25.92■■□□□ 1.74
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rdm1Q9CQK3 281 aa25.91■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 IncenpQ9WU62 880 aa25.91■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa25.91■■□□□ 1.74
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plekhd1B2RPU2 505 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Oas2E9Q9A9 742 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Amigo3Q8C2S7 508 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam213aQ9CYH2 218 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Syt10Q9R0N4 523 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smc4Q8CG47 1286 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnq3Q8K3F6 873 aa25.9■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa25.9■■□□□ 1.74
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Alg3Q8K2A8 438 aa25.89■■□□□ 1.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
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