RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640554.1

SDHD-209, Transcript of succinate dehydrogenase complex subunit D, human

TSL 5

Gene SDHD, Length 727 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDHD-209	ENST00000640554	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CAD	P27708	2225 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	AKAP9	Q99996	3911 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554		H7C417	338 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CST2	P09228	141 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	ZNF35	P13682	527 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	NR4A1	P22736	598 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CALCR	P30988	508 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	EVX1	P49640	407 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	GALK2	Q01415	458 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	HGFAC	Q04756	655 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	DAG1	Q14118	895 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	RAB35	Q15286	201 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	EFNB3	Q15768	340 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	SGCA	Q16586	387 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554		Q96M85	177 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	SNX18	Q96RF0	628 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	SH3GL3	Q99963	347 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	ITPR3	Q14573	2671 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	HIVEP1	P15822	2718 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	GSC2	O15499	205 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CCNB2	O95067	398 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	SLC2A10	O95528	541 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CELA3B	P08861	270 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	GSTM3	P21266	225 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	GLRX	P35754	106 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	DSCR9	P59020	149 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	FLOT2	Q14254	428 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	RAB39A	Q14964	217 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	FANK1	Q8TC84	345 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	NSMAF	Q92636	917 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	GPA33	Q99795	319 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CHID1	Q9BWS9	393 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	OR52D1	Q9H346	318 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	NOX3	Q9HBY0	568 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CMAHP	Q9Y471	501 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	DSCAM	O60469	2012 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	DHRS12	A0PJE2	317 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	SNAP29	O95721	258 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	OR4A8	P0C604	315 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	MSR1	P21757	451 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	PCSK6	P29122	969 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CRABP1	P29762	137 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CDKN1A	P38936	164 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	FXYD6P3	P58550	94 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	HSF2	Q03933	536 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	FMOD	Q06828	376 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	COX10	Q12887	443 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	ADIPOQ	Q15848	244 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	MICA	Q29983	383 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	MST1L	Q2TV78	715 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	MEST	Q5EB52	335 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	NABP1	Q96AH0	204 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	FBXO17	Q96EF6	278 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	C18orf12	Q96KH6	178 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	DLL4	Q9NR61	685 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	IL20	Q9NYY1	176 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.43
SDHD-209	ENST00000640554	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SDHD-209	ENST00000640554	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SDHD-209	ENST00000640554	CST1	P01037	141 aa		12.33	□□□□□ -0.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms