RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 CHRNB3Q05901 458 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CD47Q08722 323 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 NPRL3Q12980 569 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 KEAP1Q14145 624 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FLOT2Q14254 428 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 RAB39AQ14964 217 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 TAF11Q15544 211 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ADIPOQQ15848 244 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SWI5Q1ZZU3 235 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ANKDD1AQ495B1 522 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 THEM4Q5T1C6 240 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SMARCD3Q6STE5 483 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SLC22A25Q6T423 547 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 LYPD4Q6UWN0 246 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM108Q6UXF1 575 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SPNS3Q6ZMD2 512 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 C20orf204Q6ZNR8 217 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 DNM1P46Q6ZS02 220 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 RRM2BQ7LG56 351 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 LRP11Q86VZ4 500 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SPATA24Q86W54 205 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CDK20Q8IZL9 346 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 OR6V1Q8N148 313 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC18Q8N456 261 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 AQP11Q8NBQ7 271 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 WFDC11Q8NEX6 87 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 OR4K13Q8NH42 304 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 AKR7LQ8NHP1 331 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 C11orf40Q8WZ69 217 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FBXW5Q969U6 566 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 MCUR1Q96AQ8 359 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF570Q96NI8 536 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 RBP7Q96R05 134 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 NMNAT3Q96T66 252 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FEVQ99581 238 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 DHRS9Q9BPW9 319 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 TMUB1Q9BVT8 246 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 DGCR6LQ9BY27 220 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 GSX2Q9BZM3 304 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 NUAK2Q9H093 628 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 WNT5BQ9H1J7 359 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SYT4Q9H2B2 425 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FN3KQ9H479 309 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 POFUT1Q9H488 388 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SMURF2Q9HAU4 748 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 EMC7Q9NPA0 242 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 NGBQ9NPG2 151 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 OBP2BQ9NPH6 170 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 POLE4Q9NR33 117 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 DLL4Q9NR61 685 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ARMC1Q9NVT9 282 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 IL20Q9NYY1 176 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 B9D1Q9UPM9 204 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 AURKCQ9UQB9 309 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 LAMP3Q9UQV4 416 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ATP23Q9Y6H3 246 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CDH10Q9Y6N8 788 aa3□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CSPG4Q6UVK1 2322 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ABCA1O95477 2261 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 ARRDC5A6NEK1 342 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 A6NIZ1 184 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 FAM171A2A8MVW0 826 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 H3BNX3 289 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SYNGR3O43761 229 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 AHCYL1O43865 530 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SLC16A7O60669 478 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SMPD2O60906 423 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 MITFO75030 526 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 LY6HO94772 140 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 UBL3O95164 117 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SOX14O95416 240 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CLPTM1O96005 669 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 CST1P01037 141 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 IGHV4-39P01824 125 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 TFP02787 698 aa2.99□□□□□ -1.93
SNORD17-201ENST00000390930 SERPINA5P05154 406 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms