RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306167.11

MTM1-201, Transcript of myotubularin 1, humanhuman

TSL 5

Gene MTM1, Length 2,955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1-201ENST00000306167 CIPCQ9C0C6 399 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 DUSP22Q9NRW4 184 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 NDUFB11Q9NX14 153 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 MLXQ9UH92 298 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 PCTPQ9UKL6 214 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 U3KQA8 63 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 MEIKINA0A087WXM9 373 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ARGFXA6NJG6 315 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 MARCH11A6NNE9 402 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SULT1C2O00338 296 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 MPC2O95563 127 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SEMG1P04279 462 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 IL6P05231 212 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 BLKP51451 505 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 CSNK1G2P78368 415 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 HOXC5Q00444 222 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 GRB7Q14451 532 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SGCBQ16585 318 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SPIN4Q56A73 249 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 PYDC2Q56P42 97 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 LRRC73Q5JTD7 316 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 CDKL4Q5MAI5 379 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 CLEC2AQ6UVW9 174 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 CALHM3Q86XJ0 350 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 HS3ST5Q8IZT8 346 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 TMEM163Q8TC26 289 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 PNPLA2Q96AD5 504 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 MIXL1Q9H2W2 232 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 TUBB1Q9H4B7 451 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 LRTM1Q9HBL6 345 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ZNF225Q9UK10 706 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 FBXW2Q9UKT8 454 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 POMT2Q9UKY4 750 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SPATA2Q9UM82 520 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 PADI2Q9Y2J8 665 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 FIS1Q9Y3D6 152 aa4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SLC28A1O00337 649 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 E2F3O00716 465 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 CREG1O75629 220 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SC5DO75845 299 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 PTHP01270 115 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 HBQ1P09105 142 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 UGT2B7P16662 529 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 RFC3P40938 356 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 NSG1P42857 185 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 AKR1D1P51857 326 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 FOXA1P55317 472 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ACSM1Q08AH1 577 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 Q0VFX4 171 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 TTLL9Q3SXZ7 439 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 KLHL26Q53HC5 615 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 FAM198BQ6UWH4 519 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 FAM92BQ6ZTR7 304 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 DPPA4Q7L190 304 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SKA3Q8IX90 412 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 FAM9CQ8IZT9 166 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 Q8N402 240 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ZBTB2Q8N680 514 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 THRSPQ92748 146 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 DIRAS2Q96HU8 199 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 EXD2Q9NVH0 621 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 NLGN3Q9NZ94 848 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 IL36AQ9UHA7 158 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SSR3Q9UNL2 185 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 V9GYQ6 96 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 LRP4O75096 1905 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 A0A096LPI6 279 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 A0A1B0GWJ7 208 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 GPRIN2O60269 458 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 SLC19A2O60779 497 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 CLN5O75503 358 aa4.55□□□□□ -1.68
MTM1-201ENST00000306167 ATP6AP2O75787 350 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms