RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 FAM210BQ96KR6 192 aa8.3□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.3□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.3□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.3□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.3□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 MLXQ9UH92 298 aa8.3□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 ICKQ9UPZ9 632 aa8.3□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.3□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SMCO3A2RU48 225 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 GABRPO00591 440 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 DHHO43323 396 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SNAI2O43623 268 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 MPIG6BO95866 241 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CD22P20273 847 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 NPR2P20594 1047 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CAV3P56539 151 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 PFN3P60673 137 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 HERV-K104P63124 156 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 DEFA6Q01524 100 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 PCOLCEQ15113 449 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 GSG1Q2KHT4 349 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 HBMQ6B0K9 141 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 GABRG1Q8N1C3 465 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 DEFB123Q8N688 67 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 NSMAFQ92636 917 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SCRN2Q96FV2 425 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SPSB2Q99619 263 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CMKLR1Q99788 373 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SOX7Q9BT81 388 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 JAM3Q9BX67 310 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 GKN1Q9NS71 199 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 COA4Q9NYJ1 87 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 POMT2Q9UKY4 750 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 A0A1W2PR77 199 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 PRAF2O60831 178 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CELA3BP08861 270 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 FBP1P09467 338 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 LIMS3P0CW19 117 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 LIMS4P0CW20 117 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SMIM6P0DI80 62 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 ACP5P13686 325 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CXCL3P19876 107 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SLC6A6P31641 620 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CCR7P32248 378 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SRP9P49458 86 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 C2orf80Q0P641 193 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 TWF1Q12792 350 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 GINS1Q14691 196 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 TRAM2Q15035 370 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CDKN3Q16667 212 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 OR2G6Q5TZ20 316 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SLC22A10Q63ZE4 541 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 MFSD9Q8NBP5 474 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 OR56B4Q8NH76 319 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SMARCD2Q92925 531 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 RIT1Q92963 219 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 HARBI1Q96MB7 349 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CWH43Q9H720 699 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 Q9Y3F1 56 aa8.29□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 A0A087WWL8 130 aa8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 A0A0U1RRA0 63 aa8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 A0A1W2PNV4 684 aa8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 MAN2B1O00754 1011 aa8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 SDC3O75056 442 aa8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CD160O95971 181 aa8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 PPBPP02775 128 aa8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 UQCRC2P22695 453 aa8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 PSMB5P28074 263 aa8.28□□□□□ -1.08
MMP3-201ENST00000299855 TMEM33P57088 247 aa8.28□□□□□ -1.08
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