RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 PEX16Q9Y5Y5 336 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 SMIM30A4D0T7 59 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ENPP1P22413 925 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 S100A5P33763 92 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CLDN17P56750 224 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CLN3Q13286 438 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 INAQ16352 499 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CARD17Q5XLA6 110 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 HBMQ6B0K9 141 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CREB3L2Q70SY1 520 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CEACAM19Q7Z692 300 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 GLB1L2Q8IW92 636 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 UBQLNLQ8IYU4 475 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 HSD17B8Q92506 261 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ADGRG7Q96K78 797 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.19■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ZNF726A6NNF4 738 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ZNF823P16415 610 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CARD18P57730 90 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ACSM3Q53FZ2 586 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 BTLAQ7Z6A9 289 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 OR8B4Q96RC9 309 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 RNF32Q9H0A6 362 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 SMURF1Q9HCE7 757 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 FAM186AA6NE01 2351 aa20.18■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 SERPINA3P01011 423 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CELA3AP09093 270 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 SLC17A1Q14916 467 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 HIST3H3Q16695 136 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 PCK2Q16822 640 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 FAM27D1Q5T7N8 215 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CROCCP3Q8IVE0 287 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 OR9K2Q8NGE7 335 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 HAS2Q92819 552 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CEP250Q9BV73 2442 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 FAM166BA8MTA8 275 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 LINC01387J3KSC0 135 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CTDSP2O14595 271 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 GPRIN2O60269 458 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 HRGP04196 525 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CD46P15529 392 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CAV3P56539 151 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CLDN15P56746 228 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 TEX30Q5JUR7 227 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 LRRN1Q6UXK5 716 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 OR2V1Q8NHB1 315 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ABHD6Q9BV23 337 aa20.17■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 HSPB2A8KAH6 182 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 NPIPA2E9PIF3 369 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 NPIPA3F8WFD2 350 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 MAGEA5P43359 124 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 MTNR1BP49286 362 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 MEOX1P50221 254 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ARG2P78540 354 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ROM1Q03395 351 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 HSPB2Q16082 182 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 TMEM251Q8N6I4 163 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 OR10D3Q8NH80 312 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ELOVL3Q9HB03 270 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.16■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CXCL13O43927 109 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 GLSO94925 669 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ZFPL1O95159 310 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 LAP3P28838 519 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CCL11P51671 97 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 PLGLB1Q02325 96 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ZMAT1Q5H9K5 638 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 ZNF679Q8IYX0 411 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 FNDC8Q8TC99 324 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 C11orf40Q8WZ69 217 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 MCHR2Q969V1 340 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 MAP6Q96JE9 813 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 FRRS1LQ9P0K9 344 aa20.15■□□□□ 0.82
RNF170-201ENST00000240159 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms