RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588228.5

NFIX-210, Transcript of nuclear factor I X, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NFIX, Length 1,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIX-210ENST00000588228 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.76□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.76□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.76□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 SLC35F4A4IF30 521 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 LINC01387J3KSC0 135 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 TNFSF11O14788 317 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 GPRIN2O60269 458 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 SC5DO75845 299 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 ABHD16AO95870 558 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 SERPINA3P01011 423 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 PGA4P0DJD7 388 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 PGA3P0DJD8 388 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 KLK2P20151 261 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 S100A5P33763 92 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 CD97P48960 835 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 CLRN1P58418 232 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 ADAM8P78325 824 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 MFAP5Q13361 173 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 CAMK2BQ13554 666 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 INSL4Q14641 139 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 POU4F3Q15319 338 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 MFSD4AQ8N468 514 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 MDS2Q8NDY4 140 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 ABHD4Q8TB40 342 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 FNDC8Q8TC99 324 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 THEM6Q8WUY1 208 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 RNF32Q9H0A6 362 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.75□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 PSMD9O00233 223 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 CASKO14936 926 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 NKX2-8O15522 239 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 UPK3AO75631 287 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 HRGP04196 525 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 HPNP05981 417 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 SP1P08047 785 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 SPARCP09486 303 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 PSKH1P11801 424 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 BMP4P12644 408 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 PSMB10P40306 273 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 RAC3P60763 192 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 LIPNQ5VXI9 398 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 GGNQ86UU5 652 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 MFRPQ9BY79 579 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 HES7Q9BYE0 225 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 TPK1Q9H3S4 243 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 PALMDQ9NP74 551 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 A6NL46 340 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 ZNF726A6NNF4 738 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 NME2P1O60361 137 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 PRKAR1AP10644 381 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 ZNF823P16415 610 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 NME2P22392 152 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 MTNR1BP49286 362 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 GFRA1P56159 465 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 CLDN20P56880 219 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 CAMK2DQ13557 499 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 INAQ16352 499 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 TEX30Q5JUR7 227 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 SLC39A7Q92504 469 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 OR8B4Q96RC9 309 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 NR2C1P13056 603 aa14.73□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 CD46P15529 392 aa14.73□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 ROM1Q03395 351 aa14.73□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 MEP1BQ16820 701 aa14.73□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 PCK2Q16822 640 aa14.73□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.73□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 HBMQ6B0K9 141 aa14.73□□□□□ -0.05
NFIX-210ENST00000588228 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms