RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 OCEL1Q9H607 264 aa25.42■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC35F4A4IF30 521 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 CASKO14936 926 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 UPK3AO75631 287 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD96P40200 585 aa25.41■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CLEC1AQ8NC01 280 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1-210ENST00000574322 THEM6Q8WUY1 208 aa25.37■■□□□ 1.65
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-210ENST00000574322 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-210ENST00000574322 PGA4P0DJD7 388 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-210ENST00000574322 PGA3P0DJD8 388 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-210ENST00000574322 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-210ENST00000574322 SOX8P57073 446 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZMAT1Q5H9K5 638 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPANXN2Q5MJ10 180 aa25.36■■□□□ 1.65
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