RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ERVK-25	P63136	954 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	VLDLR	P98155	873 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TAF11	Q15544	211 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SLC36A2	Q495M3	483 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	LIPH	Q8WWY8	451 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RBP7	Q96R05	134 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	OR51B6	Q9H340	312 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RERGL	Q9H628	205 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RTTN	Q86VV8	2226 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880		H7C1C5	153 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	XKRY	O14609	159 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS23	O95084	383 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	GADD45G	O95257	159 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	LY6G6D	O95868	133 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	FABP3	P05413	133 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	NPR2	P20594	1047 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CDA	P32320	146 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	LCN6	P62502	163 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	HSF2	Q03933	536 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	HGFAC	Q04756	655 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	PLP2	Q04941	152 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ADIPOQ	Q15848	244 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZBED5	Q49AG3	693 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SVOPL	Q8N434	492 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SEPHS2	Q99611	448 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CDH20	Q9HBT6	801 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	FKBP7	Q9Y680	259 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ABCA1	O95477	2261 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880		A6NIZ1	184 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880		B9A039	149 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CDC42EP2	O14613	210 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	PDE5A	O76074	875 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	LY6H	O94772	140 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	STAMBP	O95630	424 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CCL2	P13500	99 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CCNO	P22674	350 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM11A	P58511	58 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	RAP1B	P61224	184 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	RAP1A	P62834	184 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	RINL	Q6ZS11	566 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF627	Q7L945	461 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF525	Q8N782	197 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	C7orf34	Q96L11	122 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF570	Q96NI8	536 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	PLK3	Q9H4B4	646 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CD300A	Q9UGN4	299 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	FZR1	Q9UM11	496 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CMAHP	Q9Y471	501 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PRQ8	180 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	UNC119B	A6NIH7	251 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CENPBD1	B2RD01	187 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880		H7C417	338 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	OR10H3	O60404	316 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	FAM157B	P0CG42	384 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CALB2	P22676	271 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	RRM2	P31350	389 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	DGCR6	Q14129	220 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SEC23B	Q15437	767 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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