RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM21Q9UKJ8 722 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZANQ9Y493 2812 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE5AO76074 875 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGA2P17301 1181 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALB2P22676 271 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 OMPP47874 163 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF84P51523 738 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD47Q08722 323 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADIPOQQ15848 244 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRN1LQ496H8 165 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 VHLLQ6RSH7 139 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 RINLQ6ZS11 566 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRM2BQ7LG56 351 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDN22Q8N7P3 220 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG12Q9BV10 488 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF442Q9H7R0 627 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 NF1P21359 2839 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSPG4Q6UVK1 2322 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENTPD5O75356 428 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 FARS2O95363 451 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 THBS4P35443 961 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINF1P36955 418 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPIBQ01892 262 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRNB3Q05901 458 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNK1Q13470 666 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB39AQ14964 217 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBED5Q49AG3 693 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM205BPQ63HN1 556 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL17RDQ8NFM7 739 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52J3Q8NH60 311 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXL3Q9UKT7 428 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3PXD2BA1X283 911 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 FABP3P05413 133 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4A8P0C604 315 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR2C1P13056 603 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF35P13682 527 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL4P36578 427 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-25P63136 954 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFNB3Q15768 340 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP2R1Q6VVX0 501 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC16A14Q7RTX9 510 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP24Q8N264 748 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSMAFQ92636 917 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 NABP1Q96AH0 204 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL1RAPQ9NPH3 570 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIGLEC7Q9Y286 467 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CR1P17927 2039 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 A6NIZ1 184 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSX4O60224 188 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTP4A3O75365 173 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 GADD45GO95257 159 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD14P08571 375 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDAP32320 146 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 FXYD6P3P58550 94 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAP1BP61224 184 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAP1AP62834 184 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAG1Q14118 895 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC36A2Q495M3 483 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 MESTQ5EB52 335 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT80Q6KB66 452 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM122BQ7Z309 247 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPPA2Q7Z7J5 298 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPA33Q99795 319 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCRBV5S2A0A599 114 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 B9A039 149 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 H7C1C5 153 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFB2O95178 105 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINA5P05154 406 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 BMP4P12644 408 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR4A1P22736 598 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRM2P31350 389 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT6P53370 316 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIPPLY3P57055 190 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMIM11AP58511 58 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCN6P62502 163 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB35Q15286 201 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 THEM4Q5T1C6 240 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCN8Q6JVE9 175 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 THSD4Q6ZMP0 1018 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms