RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055131.12

Usp48-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp48, Length 5,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48-201ENSMUST00000055131 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 CntrlA2AL36 2334 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm3543D3Z235 184 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gstm2P15626 218 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rps2P25444 293 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gabra2P26048 451 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc38a8Q5HZH7 432 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Akr7a2Q8CG76 367 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rab38Q8QZZ8 211 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr1449Q8VEV8 314 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mrgpra8Q91ZC4 305 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Snx18Q91ZR2 614 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prl8a9Q9CQ58 241 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Emc7Q9EP72 241 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm11127A7VMS2 374 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm13285B1AYI3 182 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm13275B1AYI8 182 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm10269G3UWD7 123 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Il1bP10749 269 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 SrgnP13609 152 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pnpla1Q3V1D5 599 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cfap161Q6P8Y0 303 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr314Q7TRZ7 330 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 IfnzQ8BQT1 182 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 EogtQ8BYW9 527 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm13278Q8CD73 182 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr971Q9EQ96 307 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dpp4P28843 760 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rab19P35294 217 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rras2P62071 204 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zfp39Q02525 718 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc47a2Q3V050 573 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Lyg2Q3V1I0 213 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 SpicQ6P3D7 242 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 B4gat1Q8BWP8 415 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr881Q8VF63 314 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Galnt11Q921L8 608 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 1700086D15RikQ9D9E9 151 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Foxe3Q9QY14 288 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Adamdec1Q9R0X2 467 aa16.08■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ndufaf5A2APY7 343 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mettl7a3G3X9G9 244 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 mt-Co3P00416 261 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cox4i1P19783 169 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cbr1P48758 277 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pcbd1P61458 104 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 March5Q3KNM2 278 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Eif4e1bQ3UTA9 244 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hsf5Q5ND04 624 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mettl2Q8BMK1 389 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 L3hypdhQ9CXA2 354 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dlg5E9Q9R9 1921 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 IlkO55222 452 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mmp2P33434 662 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Hmx2P43687 273 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 CryzP47199 331 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Crmp1P97427 572 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Spaca9Q7TPM5 168 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr58Q7TRF6 309 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fbxw14Q8C2Y5 466 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sdhaf2Q8C6I2 164 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 WacQ924H7 646 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slco6d1Q9D5W6 683 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ch25hQ9Z0F5 298 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Usp36B1AQJ2 1098 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gabrr3B2RXA8 464 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Chek1O35280 476 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Limk1P53668 647 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fbxo22Q78JE5 402 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Abhd17bQ7M759 288 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Inpp5kQ8C5L6 468 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Or51e2Q8VBV9 320 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Alg12Q8VDB2 486 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr777Q8VFH3 311 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmprss11dQ8VHK8 417 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mrgpra3Q91WW3 302 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem205Q91XE8 189 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pop4Q9CR08 221 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Spaca7Q9D2S4 182 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 CalyQ9DCA7 226 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 1810010D01RikA0A1L1SR87 51 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem201A2A8U2 664 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm15155B1B034 138 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pgbd5D3YZI9 523 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Opn5Q6VZZ7 377 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vangl1Q80Z96 526 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Snapc5Q8R2K7 98 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr970Q8VFN3 311 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr648Q8VG19 316 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Trp53tg5Q9D976 238 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prl3c1Q9QUN5 212 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Syt7Q9R0N7 403 aa16.07■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 1700023F06RikA2AB62 382 aa16.06■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Chst13D3Z6E3 336 aa16.06■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vmn2r76E9Q3F5 853 aa16.06■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Kcne1P23299 129 aa16.06■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Foxk1P42128 719 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rap2bP61226 183 aa16.06■□□□□ 0.16
Usp48-201ENSMUST00000055131 Defb43Q30KM9 69 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29 ms