Protein–RNA interactions for Protein: P48758

Cbr1, Carbonyl reductase [NADPH] 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbr1P48758 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Cbr1P48758 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cbr1P48758 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cbr1P48758 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Cbr1P48758 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cbr1P48758 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cbr1P48758 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cbr1P48758 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cbr1P48758 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cbr1P48758 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cbr1P48758 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cbr1P48758 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cbr1P48758 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cbr1P48758 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cbr1P48758 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cbr1P48758 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cbr1P48758 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cbr1P48758 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cbr1P48758 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cbr1P48758 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cbr1P48758 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cbr1P48758 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cbr1P48758 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cbr1P48758 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cbr1P48758 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cbr1P48758 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cbr1P48758 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cbr1P48758 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbr1P48758 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbr1P48758 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cbr1P48758 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cbr1P48758 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cbr1P48758 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cbr1P48758 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cbr1P48758 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cbr1P48758 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cbr1P48758 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cbr1P48758 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cbr1P48758 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cbr1P48758 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cbr1P48758 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cbr1P48758 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbr1P48758 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbr1P48758 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cbr1P48758 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cbr1P48758 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbr1P48758 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cbr1P48758 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cbr1P48758 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cbr1P48758 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbr1P48758 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbr1P48758 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cbr1P48758 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbr1P48758 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbr1P48758 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cbr1P48758 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cbr1P48758 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cbr1P48758 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cbr1P48758 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cbr1P48758 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cbr1P48758 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cbr1P48758 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbr1P48758 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbr1P48758 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cbr1P48758 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbr1P48758 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cbr1P48758 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbr1P48758 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cbr1P48758 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbr1P48758 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cbr1P48758 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cbr1P48758 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cbr1P48758 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cbr1P48758 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbr1P48758 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbr1P48758 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbr1P48758 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cbr1P48758 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbr1P48758 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cbr1P48758 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbr1P48758 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbr1P48758 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbr1P48758 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cbr1P48758 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbr1P48758 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbr1P48758 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbr1P48758 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbr1P48758 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbr1P48758 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbr1P48758 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbr1P48758 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbr1P48758 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbr1P48758 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbr1P48758 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cbr1P48758 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cbr1P48758 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbr1P48758 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbr1P48758 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbr1P48758 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbr1P48758 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms