RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	KRT80	Q6KB66	452 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	BIVM	Q86UB2	503 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	OR52J3	Q8NH60	311 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ASB10	Q8WXI3	467 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NSMAF	Q92636	917 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	BOD1	Q96IK1	185 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SH3GL3	Q99963	347 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CA10	Q9NS85	328 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WUU8	490 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	VSTM5	A8MXK1	200 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880		B2RBV5	119 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ARPC2	O15144	300 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ENTPD5	O75356	428 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	UBL3	O95164	117 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SLC2A10	O95528	541 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FAM107A	O95990	144 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV3-15	P01624	115 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	GALK2	Q01415	458 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SPIB	Q01892	262 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PRKCD	Q05655	676 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TNK1	Q13470	666 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SKA3	Q8IX90	412 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC18	Q8N456	261 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	MCHR2	Q969V1	340 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NOX3	Q9HBY0	568 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	AURKC	Q9UQB9	309 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RNF223	E7ERA6	249 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	IGF2	P01344	180 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV1-44	P01699	117 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	OR4A8	P0C604	315 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PAX1	P15863	534 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ITGA2	P17301	1181 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RHCE	P18577	417 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINF1	P36955	418 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FMOD	Q06828	376 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	DAG1	Q14118	895 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RAB39A	Q14964	217 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ETFDH	Q16134	617 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CARTPT	Q16568	116 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SGCA	Q16586	387 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	FITM2	Q8N6M3	262 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	PYURF	Q96I23	114 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NSL1	Q96IY1	281 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPL8	197 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	NR2C1	P13056	603 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	HSD17B1	P14061	328 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	THBS4	P35443	961 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	SLC9A3	P48764	834 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RIPPLY3	P57055	190 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SSR4-208	ENST00000471880	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35

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