RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 MARC2Q969Z3 335 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 APH1AQ96BI3 265 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 H0YIV9 168 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 I3L1I5 382 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SGK494L7N484 410 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OPN1LWP04000 364 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ELK1P19419 428 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 MMP11P24347 488 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RRADP55042 308 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 BTG1P62324 171 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OR7A5Q15622 319 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PCK2Q16822 640 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SLC22A12Q96S37 553 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ADOQ96SZ5 270 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 LRIT2A6NDA9 550 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TGOLN2O43493 480 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FURINP09958 794 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CR2P20023 1033 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 GDF1P27539 372 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 IMPA1P29218 277 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OPRD1P41143 372 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFA6P56556 154 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CD300CQ08708 224 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.19□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RNF141Q8WVD5 230 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RNF170Q96K19 258 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 GPR171O14626 319 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RAF1P04049 648 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 GABRA2P47869 451 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB103AP81534 67 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PDZK1IP1Q13113 114 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.19□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 P2RY12Q9H244 342 aa8.19□□□□□ -1.1
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PTPRM-202ENST00000400053 SLC22A11Q9NSA0 550 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SLC23A2Q9UGH3 650 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TAPBPO15533 448 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TIMP1P01033 207 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CT45A10P0DMU9 189 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SPNP16150 400 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 LAP3P28838 519 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CSN1S1P47710 185 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PSMB3P49720 205 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RAB13P51153 203 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CDC20Q12834 499 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RPE65Q16518 533 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SYT14P1Q58G82 188 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RNLSQ5VYX0 342 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 RTL10Q7L3V2 364 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF511Q8NB15 262 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PIGCQ92535 297 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 FAM122AQ96E09 287 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 C14orf79Q96F83 325 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 NMNAT3Q96T66 252 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 CCSO14618 274 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R2P9O14990 202 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-202ENST00000400053 ABLIM3O94929 683 aa8.18□□□□□ -1.1
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