RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO24O75426 580 aa18.62■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 STK17BO94768 372 aa18.62■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 CHRM2P08172 466 aa18.62■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 PPICP45877 212 aa18.62■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SYT9Q86SS6 491 aa18.62■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SECTM1Q8WVN6 248 aa18.62■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 CDCP1Q9H5V8 836 aa18.62■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SNCAP37840 140 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP8Q13202 625 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 WDR88Q6ZMY6 472 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 FRZBQ92765 325 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SLAMF9Q96A28 289 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 MRGPRX1Q96LB2 322 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 PBX4Q9BYU1 374 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SLX4Q8IY92 1834 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 TNFSF12O43508 249 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SELENOFO60613 162 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 CAMK2BQ13554 666 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 DYRK1AQ13627 763 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SIAH3Q8IW03 269 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 MVB12AQ96EY5 273 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 BCL2L10Q9HD36 194 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 M0R082 166 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 LIPNQ5VXI9 398 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 LHX8Q68G74 356 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF620Q6ZNG0 422 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 S100A7AQ86SG5 101 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 TDHQ8IZJ6 230 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 BBS1Q8NFJ9 593 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 HRH4Q9H3N8 390 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ARGFXA6NJG6 315 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 PTGER4P35408 488 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF385BQ569K4 471 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 CMC2Q9NRP2 79 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD33BA6NCL7 494 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 F10P00742 488 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 KITLGP21583 273 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 CHATP28329 748 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 CCR9P51686 369 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC74AQ96AQ1 378 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 FBXL2Q9UKC9 423 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF195O14628 629 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 AKR7A3O95154 331 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 CHRNB1P11230 501 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 KDM8Q8N371 416 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 NPAP1Q9NZP6 1156 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 TRABD2BA6NFA1 517 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 PPP3CBP16298 524 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 GALEQ14376 348 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 MYEOVQ96EZ4 313 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA4CQ9C0C4 833 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 H0YIG0 161 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.571e-10■■■□□ 14.9
CCSAP-203ENST00000366687 MC2RQ01718 297 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ8Q15842 424 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 PLPP7Q8NBV4 271 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 STT3BQ8TCJ2 826 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SEC22AQ96IW7 307 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 LRFN5Q96NI6 719 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ATPIF1Q9UII2 106 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 I6L893 689 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 DOK2O60496 412 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 NXPH2O95156 264 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SNAPINO95295 136 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF728P0DKX0 622 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 TEKQ02763 1124 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G7Q13093 441 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT9Q9HCQ5 603 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf12Q9NSK7 152 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD10Q9NXR5 420 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 B3GAT1Q9P2W7 334 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SFRP5Q5T4F7 317 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 FAM71CQ8NEG0 241 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD6Q9BV23 337 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 BTAF1O14981 1849 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 RPS19P39019 145 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 COQ3Q9NZJ6 369 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 SLC23A2Q9UGH3 650 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP13Q9UII6 198 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-203ENST00000366687 FCMRO60667 390 aa18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 205.3 ms