RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 DCXRQ7Z4W1 244 aa16.15■□□□□ 0.18
SCARB2-201ENST00000264896 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa16.15■□□□□ 0.18
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC18Q8N456 261 aa16.15■□□□□ 0.18
SCARB2-201ENST00000264896 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SCARB2-201ENST00000264896 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SCARB2-201ENST00000264896 SMLR1H3BR10 107 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 CALCBP10092 127 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 SDHAP31040 664 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 FOXK1P85037 733 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 C16orf52Q8NHV5 167 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 SMCO3A2RU48 225 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 FCGR2AP12318 317 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 MSX1P28360 303 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 HTR5AP47898 357 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 P2RX1P51575 399 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 GABREP78334 506 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 AAED1Q7RTV5 226 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 LILRB2Q8N423 598 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 PBX4Q9BYU1 374 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 SLC19A3Q9BZV2 496 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 MOB3CQ70IA8 216 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 OR1S1Q8NH92 325 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 RNF128Q8TEB7 428 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 PAQR8Q8TEZ7 354 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 SEC22CQ9BRL7 303 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 MED18Q9BUE0 208 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 KCNJ16Q9NPI9 418 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 PRDM7Q9NQW5 492 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 RAB22AQ9UL26 194 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 M0R082 166 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 ALOX12BO75342 701 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 CER1O95813 267 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 PRKACBP22694 351 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 SOX18P35713 384 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 ECH1Q13011 328 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 C12orf73Q69YU5 71 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 OR5D18Q8NGL1 313 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 MIB2Q96AX9 1013 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 NEU3Q9UQ49 428 aa16.14■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 NINQ8N4C6 2090 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 CSF3P09919 207 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 SLC36A2Q495M3 483 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 EMC4Q5J8M3 183 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF529Q6P280 563 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 TTLL8A6PVC2 850 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 NAGAP17050 411 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 SSR4P51571 173 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 BTG2P78543 158 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 OR52I2Q8NH67 350 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 SMIM19Q96E16 107 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 MRGPRX3Q96LB0 322 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 ACAD8Q9UKU7 415 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 MC2RQ01718 297 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 EDAQ92838 391 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 WDR34Q96EX3 536 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF286AQ9HBT8 521 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 PRSS23O95084 383 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 DDAH2O95865 285 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF44P15621 663 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 EPHA1P21709 976 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 CCR5P51681 352 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 DGCR2P98153 550 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 CDK5R1Q15078 307 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 SMIM3Q9BZL3 60 aa16.13■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 M0QYG6 137 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 PMS2P2O95744 297 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 S100A11P31949 105 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 CSF3RQ99062 836 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 SRRQ9GZT4 340 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 PRAMEF25A6NGN4 478 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 TK1P04183 234 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 TGM4P49221 684 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 HMGA2P52926 109 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM215Q68D42 235 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 WDR88Q6ZMY6 472 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 PRR18Q8N4B5 295 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 CLEC1AQ8NC01 280 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 TCEAL3Q969E4 200 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 DOK1Q99704 481 aa16.12■□□□□ 0.17
SCARB2-201ENST00000264896 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms