RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXF1Q12946 379 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 DNASE1L3Q13609 305 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 MFSD13AQ14CX5 517 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 BTBD16Q32M84 506 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CEP78Q5JTW2 689 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 DDI2Q5TDH0 399 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC6A19Q695T7 634 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 XKRXQ6PP77 449 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PAMR1Q6UXH9 720 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PM20D2Q8IYS1 436 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 WDSUB1Q8N9V3 476 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PHYHIPQ92561 330 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CMKLR1Q99788 373 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ULBP3Q9BZM4 244 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 POLE4Q9NR33 117 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ACOXLQ9NUZ1 547 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PRG6 482 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A23A1A5C7 686 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 FABP12A6NFH5 140 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TVP23AA6NH52 213 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 LIPT2A6NK58 231 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 C11orf98E9PRG8 122 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SERPINI2O75830 405 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 OR6A2O95222 327 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 DLGAP3O95886 979 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PTTG1O95997 202 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SERPINA3P01011 423 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PSKH1P11801 424 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SPNP16150 400 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 EDNRAP25101 427 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PTGS2P35354 604 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMB10P40306 273 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CENPAP49450 140 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 BLVRAP53004 296 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SNTA1Q13424 505 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RIN1Q13671 783 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 BAK1Q16611 211 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM27D1Q5T7N8 215 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 HBMQ6B0K9 141 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 MZT2AQ6P582 158 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 OPN5Q6U736 354 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF554Q86TJ5 538 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 POC5Q8NA72 575 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 OR13C5Q8NGS8 318 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAJA3Q96EY1 480 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP6Q96JE9 813 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL5BQ96KC2 179 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL15Q96M94 604 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TTYH2Q9BSA4 534 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SYT4Q9H2B2 425 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR76Q9H967 626 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PROK2Q9HC23 129 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL13Q9P2N7 655 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 GNG8Q9UK08 70 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RAXQ9Y2V3 346 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 LAMA1P25391 3075 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 XKRYO14609 159 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TP53I11O14683 189 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PIN1P1O15428 100 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 HPGDSO60760 199 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ITGA10O75578 1167 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 STK17BO94768 372 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PLGP00747 810 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TACSTD2P09758 323 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 HLA-DOBP13765 273 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms