RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ASB10Q8WXI3 467 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 FEVQ99581 238 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 OR10A4Q9H209 315 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 S100A14Q9HCY8 104 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MCIDASD6RGH6 385 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 UPK3AO75631 287 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 IGHV3-9P01782 118 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 COX5AP20674 150 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 IGHV1-2P23083 117 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 UGT2B10P36537 528 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 FAPQ12884 760 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CAMK2DQ13557 499 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MELKQ14680 651 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 AMIGO2Q86SJ2 522 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SVOPLQ8N434 492 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 FANK1Q8TC84 345 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM54Q969K7 222 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 OR52D1Q9H346 318 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 IL20Q9NYY1 176 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 COL12A1Q99715 3063 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 KRT33AO76009 404 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 IGHG1P01857 330 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ACADSP16219 412 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MPGP29372 298 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC6A6P31641 620 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM122BQ7Z309 247 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF566Q969W8 418 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 A6NIZ1 184 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 G3V2T6 193 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 IMPA2O14732 288 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ARPC3O15145 178 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TXNDC12O95881 172 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ITGA5P08648 1049 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PGA4P0DJD7 388 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PGA3P0DJD8 388 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PPP3CBP16298 524 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PRKACGP22612 351 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CSNK1A1P48729 337 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RPS6KA3P51812 740 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RAP1BP61224 184 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RAP1AP62834 184 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ERVK-25P63136 954 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TGFBR3Q03167 851 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 LGALS3BPQ08380 585 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 STK11Q15831 433 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 HIST3H3Q16695 136 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CARD17Q5XLA6 110 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 LINGO2Q7L985 606 aa14.49□□□□□ -0.09
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